威望、酷币、资源币获取方法及用途
基因酷保藏中心资源获取规则
保藏中心资源获取流程详细说明
基因酷保藏中心资源进出明细
领取红包获得资源币和威望
各版诚拜版主,每版欲聘5名
生物科研网址导航使用说明
生物科研网络助手使用说明
基因酷资源免费,望您点击广告
来支持基因酷
基因酷大事件回顾
论坛使用说明及酷友指南
基因酷FTP的使用及说明
基因酷个人空间(博客)使用帮助
邀请您参与《生物信息学分析系列图书》编写
祝贺酵母共享平台的建立,征集细胞株共享实验技术支持!
科研文献、资料分享交流倡议
基因酷网络资源调整公告!
情系灾区,奉献爱心
发新话题
打印

pcambia1303酶切图谱

本主题由 小宝 于 08-7-23 11:33 移动 
武林三国

pcambia1303酶切图谱

求助:那位有pcambia1303酶切图谱?急用!!!

[ 本帖最后由 wcg129 于 08-6-24 00:51 编辑 ]

TOP


阿巴贡

TOP


武林三国
总图



我怕看不清楚分开了






附件: 您所在的用户组无法下载或查看附件
本帖最近评分记录
  • 纤夫 威望 +1 精彩解答 07-9-4 16:14
阿巴贡

TOP


太感谢了 !!版主!!  我现在正急需它呢!

TOP


武林三国
版主!给我邮箱里发一个全图的好吗?  有点看不清,我的邮箱liu_chong02@163.com

TOP


已经发了,请查收!
阿巴贡

TOP


武林三国
版主能不能也给我发一个,十分感谢阿!!
jerome711@hotmail.com

TOP


酶切位点(Dnaman软件分析)

Restriction analysis on AF234299(pCAMBIA1303)
Methylation: dam-No dcm-No

Screened with 117 enzymes, 372 sites found
AatII  GACGT/C  1:   10464
Acc65I  G/GTACC  1:   11560
AccIII  T/CCGGA  4:   9589, 9725, 10262, 12026
AclI  AA/CGTT  1:   4906
AflII  C/TTAAG  2:   2198, 2624
AgeI  A/CCGGT  2:   6475, 10145
AhaIII  TTT/AAA  6:   2931, 6541, 8198, 8227, 8594, 8754
Alw44I  G/TGCAC  6:   950, 1275, 7008, 7506, 9901, 10203
AlwNI  CAGNNN/CTG  5:   859, 2504, 4721, 4789, 7608
ApaBI  GCANNNNN/TGC  5:   5437, 7017, 9036, 9910, 10186
ApaLI  G/TGCAC  6:   950, 1275, 7008, 7506, 9901, 10203
Asp718I  G/GTACC  1:   11560
AsuII  TT/CGAA  2:   1110, 2447
BalI  TGG/CCA  7:   638, 1996, 3364, 4912, 5179, 5646, 6592
BamHI  G/GATCC  1:   11569
BbeI  GGCGC/C  1:   6770
BbvII  GAAGACNN/  12:   2346, 10683, 11010, 11991, 12216, 3062, 8230, 10686, 10911,
       11013, 11238, 12219
BclI  T/GATCA  3:   106, 2362, 8909
BglI  GCCNNNN/NGGC  10:   3236, 3622, 3856, 4044, 4056, 4065, 4918, 5331, 5643, 11754
BglII  A/GATCT  1:   7
Bpu1102I  GC/TNAGC  1:   8302
Bsc91I  GAAGACNN/  12:   2346, 10683, 11010, 11991, 12216, 3062, 8230, 10686, 10911,
       11013, 11238, 12219
BsiI  C/TCGTG  6:   7365, 10715, 11042, 9904, 10383, 12187
BsmI  GAATGCN/  6:   5153, 11765, 74, 5830, 7916, 8810
Bsp1407I  T/GTACA  2:   1137, 1563
BspHI  T/CATGA  2:   901, 8452
BspMI  ACCTGCNNNN/  6:   1349, 5835, 6229, 11594, 619, 10170
BspMII  T/CCGGA  4:   9589, 9725, 10262, 12026
BssHII  G/CGCGC  2:   2795, 2819
BstD102I  GAG/CGG  6:   3605, 7125, 11504, 6691, 9738, 10096
BstEII  G/GTNACC  1:   2573
BstXI  CCANNNNN/NTGG  1:   11305
Bsu36I  CC/TNAGG  1:   2091
ClaI  AT/CGAT  2:   2208, 6061
Csp45I  TT/CGAA  2:   1110, 2447
CspI  CG/GWCCG  1:   10076
CvnI  CC/TNAGG  1:   2091
DraI  TTT/AAA  6:   2931, 6541, 8198, 8227, 8594, 8754
DraIII  CACNNN/GTG  3:   2563, 9909, 10202
DrdI  GACNNNN/NNGTC  9:   2180, 2477, 6887, 7300, 9604, 9985, 10960, 11287, 11948
EagI  C/GGCCG  18:   3299, 3527, 3531, 3857, 3961, 4335, 4411, 4872, 5389, 5635,
       5738, 5885, 5958, 6074, 6679, 9543, 10113, 10278
Ecl136II  GAG/CTC  1:   11556
Eco31I  GGTCTCN/  2:   6384, 2463
Eco52I  C/GGCCG  18:   3299, 3527, 3531, 3857, 3961, 4335, 4411, 4872, 5389, 5635,
       5738, 5885, 5958, 6074, 6679, 9543, 10113, 10278
Eco56I  G/CCGGC  16:   3301, 3475, 3525, 3529, 3556, 4055, 4413, 4730, 4870, 4959,
       5205, 5426, 5633, 5637, 5782, 6763
Eco57I  CTGAAGNNNNNNNNNNNNNNNN/  6:   1038, 2175, 4093, 5002, 7740, 11789
Eco72I  CAC/GTG  2:   2150, 2563
EcoICRI  GAG/CTC  1:   11556
EcoNI  CCTNN/NNNAGG  1:   6294
EcoRI  G/AATTC  1:   11548
EcoRV  GAT/ATC  5:   574, 805, 8029, 10653, 12253
EheI  GGC/GCC  1:   6768
EspI  GC/TNAGC  1:   8302
FseI  GGCCGG/CC  3:   3533, 4059, 5637
HindIII  A/AGCTT  1:   11599
KpnI  GGTAC/C  1:   11564
MfeI  C/AATTG  3:   147, 2385, 11997
Mlu113I  CC/GCGG  1:   8904
MluI  A/CGCGT  3:   612, 1310, 1328
MscI  TGG/CCA  7:   638, 1996, 3364, 4912, 5179, 5646, 6592
MstI  TGC/GCA  2:   6198, 11744
MstII  CC/TNAGG  1:   2091
NaeI  GCC/GGC  16:   3303, 3477, 3527, 3531, 3558, 4057, 4415, 4732, 4872, 4961,
       5207, 5428, 5635, 5639, 5784, 6765
NarI  GG/CGCC  1:   6767
NdeI  CA/TATG  4:   2055, 4526, 7015, 10035
NheI  G/CTAGC  2:   2540, 5981
NotI  GC/GGCCGC  3:   3857, 5389, 6679
NruI  TCG/CGA  2:   90, 1734
NsiI  ATGCA/T  2:   2715, 7918
PflMI  CCANNNN/NTGG  3:   2245, 4789, 5653
PinAI  A/CCGGT  2:   6475, 10145
PmaCI  CAC/GTG  2:   2150, 2563
PstI  CTGCA/G  1:   11591
PvuI  CGAT/CG  4:   2597, 9438, 10125, 11725
PvuII  CAG/CTG  4:   1090, 2501, 11372, 11694
RleAI  CCCACANNNNNNNNNNNN/  5:   2282, 6787, 59, 296, 5643
SacI  GAGCT/C  1:   11558
SacII  CCGC/GG  1:   8906
SalI  G/TCGAC  1:   11581
SapI  GCTCTTCN/  2:   7076, 6601
SauI  CC/TNAGG  1:   2091
ScaI  AGT/ACT  3:   3009, 9263, 9517
SciI  CTC/GAG  2:   9426, 10520
SfiI  GGCCNNNN/NGGCC  5:   3622, 4056, 4065, 5331, 5643
SgrAI  CR/CCGGYG  1:   6763
SmaI  CCC/GGG  2:   10503, 11566
SnaBI  TAC/GTA  1:   401
SpeI  A/CTAGT  1:   14
SphI  GCATG/C  2:   2978, 11597
SplI  C/GTACG  1:   5865
SpoI  TCG/CGA  2:   90, 1734
SspI  AAT/ATT  2:   1286, 7956
SstI  GAGCT/C  1:   11558
SstII  CCGC/GG  1:   8906
SunI  C/GTACG  1:   5865
Tth111I  GACN/NNGTC  4:   6939, 9066, 9982, 10426
VspI  AT/TAAT  4:   965, 9238, 11364, 11423
XbaI  T/CTAGA  1:   11575
XcmI  CCANNNNN/NNNNTGG  4:   2567, 3385, 4540, 8558
XhoI  C/TCGAG  2:   9424, 10518
XmaI  C/CCGGG  2:   10501, 11564
XmaIII  C/GGCCG  18:   3299, 3527, 3531, 3857, 3961, 4335, 4411, 4872, 5389, 5635,
       5738, 5885, 5958, 6074, 6679, 9543, 10113, 10278
XmnI  GAANN/NNTTC  5:   9239, 10693, 11020, 11918, 12213
XorII  CGAT/CG  4:   2597, 9438, 10125, 11725

List by Site Order
7       BglII       3527    Eco52I      5885    EagI        9909    DraIII
14      SpeI        3529    Eco56I      5885    Eco52I      9910    ApaBI
59      RleAI       3531    NaeI        5885    XmaIII      9982    Tth111I
74      BsmI        3531    XmaIII      5958    XmaIII      9985    DrdI
90      SpoI        3531    Eco52I      5958    EagI        10035   NdeI
90      NruI        3531    EagI        5958    Eco52I      10076   CspI
106     BclI        3533    FseI        5981    NheI        10096   BstD102I
147     MfeI        3556    Eco56I      6061    ClaI        10113   EagI
296     RleAI       3558    NaeI        6074    XmaIII      10113   XmaIII
401     SnaBI       3605    BstD102I    6074    Eco52I      10113   Eco52I
574     EcoRV       3622    SfiI        6074    EagI        10125   XorII
612     MluI        3622    BglI        6198    MstI        10125   PvuI
619     BspMI       3856    BglI        6229    BspMI       10145   PinAI
638     BalI        3857    XmaIII      6294    EcoNI       10145   AgeI
638     MscI        3857    Eco52I      6384    Eco31I      10170   BspMI
805     EcoRV       3857    NotI        6475    AgeI        10186   ApaBI
859     AlwNI       3857    EagI        6475    PinAI       10202   DraIII
901     BspHI       3961    EagI        6541    AhaIII      10203   ApaLI
950     Alw44I      3961    XmaIII      6541    DraI        10203   Alw44I
950     ApaLI       3961    Eco52I      6592    MscI        10262   AccIII
965     VspI        4044    BglI        6592    BalI        10262   BspMII
1038    Eco57I      4055    Eco56I      6601    SapI        10278   Eco52I
1090    PvuII       4056    BglI        6679    EagI        10278   EagI
1110    Csp45I      4056    SfiI        6679    NotI        10278   XmaIII
1110    AsuII       4057    NaeI        6679    Eco52I      10383   BsiI
1137    Bsp1407I    4059    FseI        6679    XmaIII      10426   Tth111I
1275    ApaLI       4065    BglI        6691    BstD102I    10464   AatII
1275    Alw44I      4065    SfiI        6763    Eco56I      10501   XmaI
1286    SspI        4093    Eco57I      6763    SgrAI       10503   SmaI
1310    MluI        4335    XmaIII      6765    NaeI        10518   XhoI
1328    MluI        4335    Eco52I      6767    NarI        10520   SciI
1349    BspMI       4335    EagI        6768    EheI        10653   EcoRV
1563    Bsp1407I    4411    EagI        6770    BbeI        10683   Bsc91I
1734    SpoI        4411    XmaIII      6787    RleAI       10683   BbvII
1734    NruI        4411    Eco52I      6887    DrdI        10686   BbvII
1996    MscI        4413    Eco56I      6939    Tth111I     10686   Bsc91I
1996    BalI        4415    NaeI        7008    Alw44I      10693   XmnI
2055    NdeI        4526    NdeI        7008    ApaLI       10715   BsiI
2091    CvnI        4540    XcmI        7015    NdeI        10911   Bsc91I
2091    SauI        4721    AlwNI       7017    ApaBI       10911   BbvII
2091    Bsu36I      4730    Eco56I      7076    SapI        10960   DrdI
2091    MstII       4732    NaeI        7125    BstD102I    11010   Bsc91I
2150    Eco72I      4789    AlwNI       7300    DrdI        11010   BbvII
2150    PmaCI       4789    PflMI       7365    BsiI        11013   BbvII
2175    Eco57I      4870    Eco56I      7506    Alw44I      11013   Bsc91I
2180    DrdI        4872    EagI        7506    ApaLI       11020   XmnI
2198    AflII       4872    Eco52I      7608    AlwNI       11042   BsiI
2208    ClaI        4872    XmaIII      7740    Eco57I      11238   Bsc91I
2245    PflMI       4872    NaeI        7916    BsmI        11238   BbvII
2282    RleAI       4906    AclI        7918    NsiI        11287   DrdI
2346    BbvII       4912    MscI        7956    SspI        11305   BstXI
2346    Bsc91I      4912    BalI        8029    EcoRV       11364   VspI
2362    BclI        4918    BglI        8198    AhaIII      11372   PvuII
2385    MfeI        4959    Eco56I      8198    DraI        11423   VspI
2447    AsuII       4961    NaeI        8227    DraI        11504   BstD102I
2447    Csp45I      5002    Eco57I      8227    AhaIII      11548   EcoRI
2463    Eco31I      5153    BsmI        8230    Bsc91I      11556   Ecl136II
2477    DrdI        5179    MscI        8230    BbvII       11556   EcoICRI
2501    PvuII       5179    BalI        8302    Bpu1102I    11558   SacI
2504    AlwNI       5205    Eco56I      8302    EspI        11558   SstI
2540    NheI        5207    NaeI        8452    BspHI       11560   Asp718I
2563    DraIII      5331    SfiI        8558    XcmI        11560   Acc65I
2563    PmaCI       5331    BglI        8594    DraI        11564   XmaI
2563    Eco72I      5389    XmaIII      8594    AhaIII      11564   KpnI
2567    XcmI        5389    NotI        8754    DraI        11566   SmaI
2573    BstEII      5389    Eco52I      8754    AhaIII      11569   BamHI
2597    XorII       5389    EagI        8810    BsmI        11575   XbaI
2597    PvuI        5426    Eco56I      8904    Mlu113I     11581   SalI
2624    AflII       5428    NaeI        8906    SstII       11591   PstI
2715    NsiI        5437    ApaBI       8906    SacII       11594   BspMI
2795    BssHII      5633    Eco56I      8909    BclI        11597   SphI
2819    BssHII      5635    XmaIII      9036    ApaBI       11599   HindIII
2931    AhaIII      5635    Eco52I      9066    Tth111I     11694   PvuII
2931    DraI        5635    EagI        9238    VspI        11725   PvuI
2978    SphI        5635    NaeI        9239    XmnI        11725   XorII
3009    ScaI        5637    Eco56I      9263    ScaI        11744   MstI
3062    Bsc91I      5637    FseI        9424    XhoI        11754   BglI
3062    BbvII       5639    NaeI        9426    SciI        11765   BsmI
3236    BglI        5643    BglI        9438    PvuI        11789   Eco57I
3299    EagI        5643    RleAI       9438    XorII       11918   XmnI
3299    Eco52I      5643    SfiI        9517    ScaI        11948   DrdI
3299    XmaIII      5646    MscI        9543    EagI        11991   BbvII
3301    Eco56I      5646    BalI        9543    XmaIII      11991   Bsc91I
3303    NaeI        5653    PflMI       9543    Eco52I      11997   MfeI
3364    MscI        5738    XmaIII      9589    BspMII      12026   BspMII
3364    BalI        5738    EagI        9589    AccIII      12026   AccIII
3385    XcmI        5738    Eco52I      9604    DrdI        12187   BsiI
3475    Eco56I      5782    Eco56I      9725    AccIII      12213   XmnI
3477    NaeI        5784    NaeI        9725    BspMII      12216   BbvII
3525    Eco56I      5830    BsmI        9738    BstD102I    12216   Bsc91I
3527    NaeI        5835    BspMI       9901    Alw44I      12219   BbvII
3527    EagI        5865    SplI        9901    ApaLI       12219   Bsc91I
3527    XmaIII      5865    SunI        9904    BsiI        12253   EcoRV


Non Cut Enzymes
ApaI        AscI        AvrII       Eam1105I    Eco47III    HpaI
I-PpoI      NcoI        PacI        PmeI        SrfI        StuI
SwaI
阿巴贡

TOP


武林三国
有很多酷友反映看不是很清楚,我从新做了一张,另外加了酶切位点分析(见楼上)


图谱

附件: 您所在的用户组无法下载或查看附件
本帖最近评分记录
  • gene℃ 威望 +1 wcg129版主辛苦了 08-6-24 09:28
阿巴贡

TOP



构建shRNA表达载体

我是新手,我想构建shRNA表达载体,但有不会,请大家多多帮助哈,给我指教下,谢谢哈,我的邮箱是rschong@126.com 给我联系指导哈 谢谢了!!急************

TOP

发新话题