[质粒图谱] pCAMBIA-2301质粒图谱及相关信息

pCAMBIA-2301质粒图谱及相关信息
! r. P% q2 M- T6 A4 |) n3 u( g1 u4 I
6 A9 s) C$ u: Y/ C5 u+ O+ X- U) s; m5 a图谱库ID：, E4 h8 J, o5 t& A

- b3 h9 t% P$ m" Z: G4 A8 {质粒名称：pCAMBIA-2301
! U& j, ], n3 T7 Q* W, V1 u' N2 h) i/ b4 p
载体类型：Bacterial
$ m3 y1 l# r( h+ u& ~# w# A/ \5 i/ i9 A! Z
载体抗性：Kanamycin" p# w& A# C: x  V' P, J3 s
+ Y+ c4 p1 E& Y) C4 ~
培养条件：Grow in standard E. coli @ 37C) j: A9 A% K" r2 F+ D

# j5 U7 \% ~( f3 p& L: TpCAMBIA-2301图谱：1 u6 [1 V" p5 M& ~5 Y# h

5 G3 b6 ~# W8 l' N( P附加信息如下：
' a) ?; l% j0 w# t, V8 N5 B( N
& \; ~) h! _  SLOCUS       AF234316               11633 bp    DNA     circular SYN 24-APR-2000! H9 Q0 l# T, B" C
DEFINITION  Binary vector pCAMBIA-2301, complete sequence.
/ l) [. D" v8 S6 D* z+ C+ t9 T. QACCESSION   AF234316
& N, U. l- {7 q7 `- R" }VERSION     AF234316.1  GI:7638149
. a! U$ {; G7 w* t1 {4 TKEYWORDS    .
4 w5 z  f. s2 I" e+ XSOURCE      Binary vector pCAMBIA-23018 A5 F* i; A3 @0 X
  ORGANISM  Binary vector pCAMBIA-23011 M1 ?) f: j( S
            other sequences; artificial sequences; vectors.7 L( @+ ^. `8 [$ s. e
REFERENCE   1  (sites)0 w+ l% x( m$ j- Y% `: _2 d% }
  AUTHORS   Hajdukiewicz,P., Svab,Z. and Maliga,P.
5 W" ?! Z* ~& r+ G3 g  TITLE     The small, versatile pPZP family of Agrobacterium binary vectors
& f. c1 F' O. S8 ^% Q1 D6 ]            for plant transformation! S" s9 ^0 x" k! T* j/ `
  JOURNAL   Plant Mol. Biol. 25 (6), 989-994 (1994)
) }7 ^0 p0 T, L: v5 ^6 }0 z   PUBMED   7919218; g) @" ~: V2 F  B% l2 a) m
REFERENCE   2  (bases 1 to 11633)/ t# q, o3 O: p5 K( ^+ v
  AUTHORS   Roberts,C., Rajagopal,S., Smith,L.M., Nguyen,T.A., Yang,W.,
8 v( i, J3 _* \' R6 {" _            Nugrohu,S., Ravi,K.S., Vijayachandra,K., Harcourt,R.L.,
( ]5 L( v' ~% y: C' ?4 v            Dransfield,L., Desamero,N., Slamet,I., Hadjukiewicz,P., Svab,Z.,+ o; |5 x& x: L# t; C% L- l
            Maliga,P., Mayer,J.E., Keese,P.K., Kilian,A. and Jefferson,R.A.
4 K" A+ z; ~5 N. J! G  TITLE     A comprehensive set of modular vectors for advanced manipulations
# c* Y, |* \6 G# Q/ X; a            and efficient transformation of plants
9 G+ S  ^+ c6 W5 E1 z  JOURNAL   Unpublished5 g% W9 q' e9 @2 B# B' X1 w4 r2 s
  REMARK    Full description of constructs
! E' t3 w" g. `% @" Q3 NREFERENCE   3  (bases 1 to 11633)! ^- Q: }) l. C( X: u" w
  AUTHORS   Roberts,C., Rajagopal,S., Smith,L.M., Nguyen,T.A., Yang,W.,
5 E* n' [( J) K8 r# J% y4 D            Nugrohu,S., Ravi,K.S., Vijayachandra,K., Harcourt,R.L.,
: z* S3 A' Q$ P  ^8 d            Dransfield,L., Desamero,N., Slamet,I., Hadjukiewicz,P., Svab,Z.,
8 n" m- R3 `5 {* Q" k            Maliga,P., Mayer,J.E., Keese,P.K., Kilian,A. and Jefferson,R.A.. ]* s, g2 h2 }  B! z
  TITLE     Direct Submission
* o5 G7 g) n1 G2 O, |2 t( ?  v  JOURNAL   Submitted (15-FEB-2000) CAMBIA, Clunies Ross St, Black Mountain /" p. e$ ^0 K7 P3 D
            GPO Box 3200, Canberra, ACT 2601, Australia7 v7 A4 B1 B( U& H5 l1 b
FEATURES             Location/Qualifiers
4 G" a- e) I7 U2 L$ m0 F     source          1..11633
8 m, R8 D- F* z' @/ M                     /organism="Binary vector pCAMBIA-2301"2 K/ B' `# b- {/ f, Q1 k; D6 d
                     /mol_type="other DNA"8 t" |; s1 k5 D
                     /db_xref="taxon:118408"$ E0 M) ~( `) G1 I9 u
     CDS             join(2..16,207..2054)
6 T  ]: t3 q6 ^  X1 _3 Z' O                     /codon_start=19 W' q! d* p+ k; W/ [& m
                     /product="GUSA, hexaHis tagged"
$ t9 i+ [- E2 a0 O0 N7 s$ |  b: G                     /protein_id="AAF65404.1"
% B0 G/ T) j. u4 H+ V                     /db_xref="GI:7638153"
' U7 `. j0 v" N2 ~3 I                     /translation="MVDLRNRRLVRPVETPTREIKKLDGLWAFSLDRENCGIDQRWWE# z. R; l3 X( {# Y2 g6 r$ ~
                     SALQESRAIAVPGSFNDQFADADIRNYAGNVWYQREVFIPKGWAGQRIVLRFDAVTHY, l8 Z1 S. J7 t. T& u- x
                     GKVWVNNQEVMEHQGGYTPFEADVTPYVIAGKSVRITVCVNNELNWQTIPPGMVITDE. v) j1 v' @( `' [; Y$ V6 L
                     NGKKKQSYFHDFFNYAGIHRSVMLYTTPNTWVDDITVVTHVAQDCNHASVDWQVVANG
, e. R+ G/ ?0 q8 I' I                     DVSVELRDADQQVVATGQGTSGTLQVVNPHLWQPGEGYLYELEVTAKSQTESDIYPLR
, {4 ^1 I3 q4 u5 ~                     VGIRSVAVKGQQFLINHKPFYFTGFGRHEDADLRGKGFDNVLMVHDHALMDWIGANSY
9 _; L% A) c" x1 f* `                     RTSHYPYAEEMLDWADEHGIVVIDETAAVGFQLSLGIGFEAGNKPKELYSEEAVNGET
. Q2 M$ l* v- X- C                     QQAHLQAIKELIARDKNHPSVVMWSIANEPDTRPQGAREYFAPLAEATRKLDPTRPIT
4 v0 S8 a- I/ ]+ X1 b1 H                     CVNVMFCDAHTDTISDLFDVLCLNRYYGWYVQSGDLETAEKVLEKELLAWQEKLHQPI7 h. ~$ D8 f8 q  X
                     IITEYGVDTLAGLHSMYTDMWSEEYQCAWLDMYHRVFDRVSAVVGEQVWNFADFATSQ7 v1 r' N1 ?/ V; w
                     GILRVGGNKKGIFTRDRKPKSAAFLLQKRWTGMNFGEKPQQGGKQASHHHHHHV"* ?. F- H& p  U+ S5 Y3 w
     exon            2..16! h* W1 H1 Y& {8 U0 s4 Y
                     /note="synthetic first gus exon (modular)"- D; }1 B# H1 h* I7 S2 ~
     intron          17..2065 r9 X& `5 N+ S7 R
                     /note="Castorbean catalase intron; modified"8 ~( Z5 u( n5 g: }0 T+ j1 V
     exon            207..20548 m9 n) V8 t1 R
                     /note="second gusA exon, His6"
1 ?% b3 L# l( Q     misc_feature    2086..2338
  U9 E& \% v% f6 P                     /note="nos (nopaline synthase) 3'UTR (polyA signal)"
* k0 _* P' B8 V7 N# x# ^9 K     misc_feature    2376..2401% |+ c" x2 \- U0 t7 d0 ?
                     /note="right border T-DNA repeat"
8 T. W3 [) `2 k( J+ Z4 E& i2 U& D     misc_feature    complement(3442..4442)5 k6 N# U2 d6 E) ^9 H5 O
                     /note="STA region from pVS1 plasmid"
% Y0 ?  M) q) W4 S     rep_origin      complement(5035..6035), n" \7 r+ |7 u( ?7 q
                     /note="pVS1-REP; replication origin from pVS1"1 b: f3 L8 H" ?5 d5 s' x
     misc_feature    complement(6445..6705)
/ ~- `& ^! P0 J+ e6 p2 ^9 C* i0 C                     /note="bom site from pBR322"  X$ o+ h- S. `" E+ E. c3 Z
     rep_origin      complement(6845..7125)
* r% l  x  K) ]8 }6 s1 g                     /note="pBR322 origin of replication"0 A0 p, s2 X, v; |
     CDS             complement(7416..8210)
9 _* l4 E9 V3 a% {8 `" z                     /note="aadA (kanamycin resistance) gene amplified from
$ h& C0 Z+ V3 E4 E                     pIG121Hm"
# T2 G! `7 L, [/ C6 l) h# H                     /codon_start=1( c5 k. Q8 V& x& b( _
                     /product="aminoglycoside phosphotransferase"3 m% E$ P; R2 p" ?, k* M
                     /protein_id="AAF65402.1"! K. _6 Z; _2 {8 ^3 D
                     /db_xref="GI:7638151"
4 g, b" f# J& y. J( r, o                     /translation="MAKMRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLK6 R2 P0 i8 f/ p  f: |# T- k
                     MTDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEY2 J1 r$ q7 B& M- Q2 F
                     EDEQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWE5 O7 f" [/ b7 E
                     EDTPFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKW7 ]% M1 G+ t' j4 B# R  A" E
                     YDIAFCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF"
9 M+ n1 m: ~0 z+ Y5 c     misc_feature    8635..8660
  r- S; J9 ^: o3 X! {                     /note="left border repeat from C58 T-DNA"
: D# J; j) z% E* U( O( ?     misc_feature    8727..89309 ^) ]' N2 h( H1 R9 @
                     /note="CaMV 3'UTR (polyA signal)"/ F8 ^1 @6 C/ ]! t! ?6 ?2 L+ F
     CDS             complement(8968..9765)
  m' P( _0 V& m2 K& T                     /note="nptII (kanamycin resistance) gene"7 n* Y$ T) g; V
                     /codon_start=1
5 Y: U# F* y5 d5 p$ b                     /product="neomycin phosphotransferase"* O# a) G& `  ?% Q8 {4 {3 Q
                     /protein_id="AAF65403.1"6 [# o6 j2 z& }4 E
                     /db_xref="GI:7638152"6 r( @: j) K0 b) k, [
                     /translation="MGIEQDGLHAGSPAAWVERLFGYDWAQQTIGCSDAAVFRLSAQG
+ Y1 \9 A$ }! \: Z! l5 L                     RPVLFVKTDLSGALNELQDEAARLSWLATTGVPCAAVLDVVTEAGRDWLLLGEVPGQD
* K0 U# \7 B% e/ O                     LLSSHLAPAEKVSIMADAMRRLHTLDPATCPFDHQAKHRIERARTRMEAGLVDQDDLD
- K: J# x/ Q7 u7 V# H                     EEHQGLAPAELFARLKARMPDGEDLVVTHGDACLPNIMVENGRFSGFIDCGRLGVADR# R' R- C/ m4 t: F! @! _2 O0 B
                     YQDIALATRDIAEELGGEWADRFLVLYGIAAPDSQRIAFYRLLDEFF"
% d. i) G1 a$ i5 ]' H0 a* o- p     promoter        complement(9796..10576)
# L1 g0 I: h/ m" z: p                     /note="CaMV35S2; CaMV 35S promoter, duplicated"* ~0 V, S- ^7 n
     promoter        10724..10778
" J7 i! g0 m1 W! l( h; g                     /note="PlacZ; lacZ promoter"
' y( Z  x# d* ]/ h6 w     CDS             10806..11039
$ E% S. a' i2 [; ~) z3 w                     /codon_start=17 q% t$ u. s; t# G- N. P$ D1 e8 d
                     /product="LacZ alpha fragment"
+ e% ]! N9 a% h: _2 f! ^                     /protein_id="AAF65401.1"
- w$ L( J7 P- I0 b: a# c                     /db_xref="GI:7638150": m8 c( i. I! d! q7 l3 m0 B6 j8 D0 K& |
                     /translation="MTMITNSSSVPGDPLESTCRHASLALAVVLQRRDWENPGVTQLN
4 i# r. q( U/ V$ ^# ?0 j7 B4 H                     RLAAHPPFASWRNSEEARTDRPSQQLRSLNGEC"
- B, o8 r' _. T$ K* f     misc_feature    10820..10876
6 h3 z6 n1 J4 l' ]$ f) ^                     /note="pUC18 MCS; polylinker": f- x% B. B& b2 K3 o' B; s. v
     promoter        11090..11627
- m$ V+ O, D& m- m! K                     /note="CaMV35S; 35S promoter from CaMV"
5 \3 K: v5 T6 M8 c0 T) J7 EORIGIN      - ?! q# g; i' q! ]' l
        1 catggtagat ctgagggtaa atttctagtt tttctccttc attttcttgg ttaggaccct
0 J1 f# Q  I6 C" l* i. s" \; p       61 tttctctttt tatttttttg agctttgatc tttctttaaa ctgatctatt ttttaattga( N  W. @. s$ ?
      121 ttggttatgg tgtaaatatt acatagcttt aactgataat ctgattactt tatttcgtgt! h9 D: x8 b% N  A. H
      181 gtctatgatg atgatgatag ttacagaacc gacgactcgt ccgtcctgta gaaaccccaa
+ e1 f% L$ E1 t1 v      241 cccgtgaaat caaaaaactc gacggcctgt gggcattcag tctggatcgc gaaaactgtg
1 s0 u$ K5 ]9 R& J      301 gaattgatca gcgttggtgg gaaagcgcgt tacaagaaag ccgggcaatt gctgtgccag
8 p% E4 l, a( e4 e      361 gcagttttaa cgatcagttc gccgatgcag atattcgtaa ttatgcgggc aacgtctggt2 t. G5 b7 ~# m% L5 k
      421 atcagcgcga agtctttata ccgaaaggtt gggcaggcca gcgtatcgtg ctgcgtttcg
! N8 y- `- }0 H3 D% D      481 atgcggtcac tcattacggc aaagtgtggg tcaataatca ggaagtgatg gagcatcagg# T* K0 M1 p6 `* |$ n  u8 n2 c$ Y
      541 gcggctatac gccatttgaa gccgatgtca cgccgtatgt tattgccggg aaaagtgtac# t; @! d; o( S
      601 gtatcaccgt ttgtgtgaac aacgaactga actggcagac tatcccgccg ggaatggtga
7 V& U2 |2 ^1 k      661 ttaccgacga aaacggcaag aaaaagcagt cttacttcca tgatttcttt aactatgccg3 J* z) n' D- N* i# R/ a# E1 b
      721 gaatccatcg cagcgtaatg ctctacacca cgccgaacac ctgggtggac gatatcaccg
- E1 ?1 u, q% ^* X  l& o' r( Z/ ^! }      781 tggtgacgca tgtcgcgcaa gactgtaacc acgcgtctgt tgactggcag gtggtggcca
( R- ^  M! t5 j# v: ]7 G  `) k) |- ^      841 atggtgatgt cagcgttgaa ctgcgtgatg cggatcaaca ggtggttgca actggacaag" ]! y1 i7 [( T+ |1 ]; z& n  h/ E
      901 gcactagcgg gactttgcaa gtggtgaatc cgcacctctg gcaaccgggt gaaggttatc
' r3 r) J" ^* @9 r( A      961 tctatgaact cgaagtcaca gccaaaagcc agacagagtc tgatatctac ccgcttcgcg
8 a5 G& a. E" D7 ^+ ]! T  s     1021 tcggcatccg gtcagtggca gtgaagggcc aacagttcct gattaaccac aaaccgttct
# L+ s5 q& o$ e3 A5 N) K% @& F7 x& f     1081 actttactgg ctttggtcgt catgaagatg cggacttacg tggcaaagga ttcgataacg
; ]/ o0 x$ \9 c7 H% {/ C% k8 a8 T     1141 tgctgatggt gcacgaccac gcattaatgg actggattgg ggccaactcc taccgtacct
' ^3 b) F2 S* y. c6 L     1201 cgcattaccc ttacgctgaa gagatgctcg actgggcaga tgaacatggc atcgtggtga
: |! V% A6 h8 k' e5 c- v8 [     1261 ttgatgaaac tgctgctgtc ggctttcagc tgtctttagg cattggtttc gaagcgggca
( y9 Q5 H( c1 Y     1321 acaagccgaa agaactgtac agcgaagagg cagtcaacgg ggaaactcag caagcgcact
! t. _% c; J# w4 B5 S% ~     1381 tacaggcgat taaagagctg atagcgcgtg acaaaaacca cccaagcgtg gtgatgtgga; U" G. Y: s0 T
     1441 gtattgccaa cgaaccggat acccgtccgc aaggtgcacg ggaatatttc gcgccactgg
  w# Y4 N# O9 O* m* f0 U* a     1501 cggaagcaac gcgtaaactc gacccgacgc gtccgatcac ctgcgtcaat gtaatgttct
( q" z" z9 M8 n     1561 gcgacgctca caccgatacc atcagcgatc tctttgatgt gctgtgcctg aaccgttatt
7 l& |! Y' m$ X     1621 acggatggta tgtccaaagc ggcgatttgg aaacggcaga gaaggtactg gaaaaagaac& _" T( N( S, `
     1681 ttctggcctg gcaggagaaa ctgcatcagc cgattatcat caccgaatac ggcgtggata! N# l8 Q) e& A' B, M- K
     1741 cgttagccgg gctgcactca atgtacaccg acatgtggag tgaagagtat cagtgtgcat' w$ q+ d2 E0 U$ w! h
     1801 ggctggatat gtatcaccgc gtctttgatc gcgtcagcgc cgtcgtcggt gaacaggtat! W9 ?8 \, c3 O" E' u
     1861 ggaatttcgc cgattttgcg acctcgcaag gcatattgcg cgttggcggt aacaagaaag
0 x4 g2 E' T+ S' b# _  _# b     1921 ggatcttcac tcgcgaccgc aaaccgaagt cggcggcttt tctgctgcaa aaacgctgga
3 Q: o9 k, c- ?0 K: k$ {     1981 ctggcatgaa cttcggtgaa aaaccgcagc agggaggcaa acaagctagc caccaccacc. A4 p' [% I: F7 Q. g4 K) T2 u
     2041 accaccacgt gtgaattaca ggtgaccagc tcgaatttcc ccgatcgttc aaacatttgg
& E, T5 F8 T$ [     2101 caataaagtt tcttaagatt gaatcctgtt gccggtcttg cgatgattat catataattt
+ \, i3 A2 g  U. r. L     2161 ctgttgaatt acgttaagca tgtaataatt aacatgtaat gcatgacgtt atttatgaga
. E+ g7 l9 A/ u5 I8 T* F     2221 tgggttttta tgattagagt cccgcaatta tacatttaat acgcgataga aaacaaaata% Q. Z# X( a; I+ O' }5 a. w' U/ {1 J9 T
     2281 tagcgcgcaa actaggataa attatcgcgc gcggtgtcat ctatgttact agatcgggaa
5 E: j! q' x, v- I0 s     2341 ttaaactatc agtgtttgac aggatatatt ggcgggtaaa cctaagagaa aagagcgttt1 @) T- U$ B+ r' D7 [3 u2 h# Y( s
     2401 attagaataa cggatattta aaagggcgtg aaaaggttta tccgttcgtc catttgtatg, g& a  R$ ?, p* J! D, f- t
     2461 tgcatgccaa ccacagggtt cccctcggga tcaaagtact ttgatccaac ccctccgctg
2 X( H: W7 @0 J- O     2521 ctatagtgca gtcggcttct gacgttcagt gcagccgtct tctgaaaacg acatgtcgca' D! J9 V+ G/ g0 m
     2581 caagtcctaa gttacgcgac aggctgccgc cctgcccttt tcctggcgtt ttcttgtcgc
& O2 i# w6 S6 ?( o. c% v     2641 gtgttttagt cgcataaagt agaatacttg cgactagaac cggagacatt acgccatgaa5 L* x0 s  X! G% Q
     2701 caagagcgcc gccgctggcc tgctgggcta tgcccgcgtc agcaccgacg accaggactt, o0 R9 }" ]& a+ ?( c9 m
     2761 gaccaaccaa cgggccgaac tgcacgcggc cggctgcacc aagctgtttt ccgagaagat
. v. L" V: G) x7 s( k     2821 caccggcacc aggcgcgacc gcccggagct ggccaggatg cttgaccacc tacgccctgg
: D5 j$ b/ y0 ]$ L     2881 cgacgttgtg acagtgacca ggctagaccg cctggcccgc agcacccgcg acctactgga' B2 N- f( [, l& R' g  j( c: j3 c
     2941 cattgccgag cgcatccagg aggccggcgc gggcctgcgt agcctggcag agccgtgggc- E& F+ |1 b' p# h
     3001 cgacaccacc acgccggccg gccgcatggt gttgaccgtg ttcgccggca ttgccgagtt
' W" N) v" O. Z# f+ w7 G: i     3061 cgagcgttcc ctaatcatcg accgcacccg gagcgggcgc gaggccgcca aggcccgagg
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$ S7 F" P8 c- V0 X3 o0 M# m) `0 Q    10681 tgagcgcaac gcaattaatg tgagttagct cactcattag gcaccccagg ctttacactt( [; [5 p5 C* G
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    10981 aagaggcccg caccgatcgc ccttcccaac agttgcgcag cctgaatggc gaatgctaga1 x# e9 J* M4 x$ |4 |
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    11101 agattcaaat agaggaccta acagaactcg ccgtaaagac tggcgaacag ttcatacaga
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0 f8 l2 I, ?' _+ F7 @% u: x( i8 X, W$ w    11221 ttgtctactc caaaaatatc aaagatacag tctcagaaga ccaaagggca attgagactt# @( X8 o- [. D: i8 M4 K
    11281 ttcaacaaag ggtaatatcc ggaaacctcc tcggattcca ttgcccagct atctgtcact
, Z0 S6 c" p  [  Z6 J' p; @+ [    11341 ttattgtgaa gatagtggaa aaggaaggtg gctcctacaa atgccatcat tgcgataaag
6 l  o8 F& c. M. U    11401 gaaaggccat cgttgaagat gcctctgccg acagtggtcc caaagatgga cccccaccca6 i0 N- Y9 M- x+ m) y# ?" S% \
    11461 cgaggagcat cgtggaaaaa gaagacgttc caaccacgtc ttcaaagcaa gtggattgat4 k/ B! W8 I1 v# T2 X
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