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【求助】引物设计



【求助】引物设计

我现在刚接触分子生物学的知识,有很多地方都不大明白.
尤其在引物设计这块就遇到了困难.因为我的基因序列里有NdeI的序列,所以想找它的同工酶.
想问一下,NdeI的同工酶是什么?
 
谢谢各位啊!

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Re: 【求助】引物设计

关于引物设计来说楼主可以参考一下帖子:

分享】Primer Premier使用手册中文版--教你如何使用软件设计引物 
                           www.genecool.com/bbs/21684/ShowPost.aspx
【原创】oligo使用图解 
                           www.genecool.com/bbs/26867/ShowPost.aspx 

感觉你的问法怪怪的呢??呵呵也许我没有懂哈!你是不是想知道与NdeI酶切位点相同的酶啊??如果是这个意思的话那么与之相同的酶应该就是FauND I 其酶切位点为:c~atatg。
 
 同工酶:
     1972 年Pitot将早期概念上的同工酶, 即催化相同反应的酶蛋白分为以下4 类: ① 共同酶( synzyme):指同一基因编码的具有相同氨基酸顺序而有不同空间构象或翻译后经不同修饰的酶蛋白; ②同工酶( isozyme) :指同一种属中由不同基因位点编码的氨基酸组成不同的酶蛋白; ③等位基因酶(allozyme) :指同一种属中由同一基因位点上不同等位基因所编码的酶蛋白; ④ 异种酶(xenozyme) :指不同种属生物中催化相同反应的酶蛋白。Pitot 在这里将早期概念上同工酶与基因位点联系起来进行分类, 这种分类无疑促进了人们从来源上对催化相同反应的酶蛋白的本质认识, 即对酶的源本认识;但Pitot 提出的同工酶仅是狭义上的同工酶, 即由不同基因位点编码的不同的酶蛋白。
       1976 年国际生化学会生化命名委员会(CBN )建议,将同工酶定义为“在同一种属中, 由不同基因位点或等位基因编码的多肽链的单体、纯聚体或杂聚体, 其理化及生物性质不同而能催化相同化学反应的酶”。这一定义包括了Pitot 的第②、③两项, 而将转录后产生的酶变体, 即次级同工酶不在认为是同工酶, 因为它们没有相对应的编码基因, 有的可能是由实验条件所引起的分子变化, 未必都存在于天然生物体内。该定义首次从来源、功能、结构和理化性质上给同工酶作了较好的界定, 也是目前被大多学者所认可的广义的同工酶概念。但近期有些文献使用的“同工酶”定义则是狭义的, 它仅指由不同基因位点所编码的同一种酶的不同形式。




   

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Re: 【求助】引物设计

按理序列里有就应该避免使用啊,为什么还要使用同工酶?

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Re: 【求助】引物设计

同工酶查找: http://rebase.neb.com/rebase/rebase.html

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Re: 【求助】引物设计

谢谢楼上的帮忙啊! 可能是我问错了.其实我是想知道有什么酶切位点可以和NdeI识别相同的位点,但碱基不同.例如:Nco I (CCATGG)和BspH I (TCATGA),识别相同位点但碱基不同.

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Re: 【求助】引物设计

FauND I ,楼主我已经告知你了啊,你没有仔细看我的回复的哦

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Re: 【求助】引物设计

hehe!我仔细看了啊!但是FauND I和NdeI碱基也相同呀,所以不行.因为我要扩增的序列里含有NdeI,所以想找个跟他碱基不同但能识别同样位点的酶切位点.

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