威望、酷币、资源币获取方法及用途
基因酷保藏中心资源获取规则
保藏中心资源获取流程详细说明
基因酷保藏中心资源进出明细
领取红包获得资源币和威望
各版诚拜版主,每版欲聘5名
生物科研网址导航使用说明
生物科研网络助手使用说明
基因酷资源免费,望您点击广告
来支持基因酷
基因酷大事件回顾
论坛使用说明及酷友指南
基因酷FTP的使用及说明
基因酷个人空间(博客)使用帮助
邀请您参与《生物信息学分析系列图书》编写
祝贺酵母共享平台的建立,征集细胞株共享实验技术支持!
科研文献、资料分享交流倡议
基因酷网络资源调整公告!
情系灾区,奉献爱心
发新话题
打印

【求助】各位大侠,帮忙啊



【求助】各位大侠,帮忙啊

    我的基因开放阅读框已经得到,要进行整个基因的原核表达实验。我根据开放阅读框的酶切及表达载体分析,确定了两种内切酶,Ecor I和Not I,在起始密码字和终止密码子附近设计了酶切引物,但是PCR的时候只出来引物二聚体,没有目的条带。模板和酶确保没问题。将酶切引物在primer上检测,效率很低几乎全是红。但是引物只能这么设计了,各位大侠,我通过什么办法可以得到我要的目的片段呢?急!!!!恳切希望得到指导,谢谢了。

TOP



Re: 【求助】各位大侠,帮忙啊

郁闷中人酷友: 您好!引物效率低,几乎全时红,可能是引物设计的不好了, 在没有其他办法的情况下,不妨试试以第一轮的PCR产物为模板再括一下第二轮,也许第一轮产物太少,跑胶看不到;再扩一轮没准就出来了,呵呵,我经常使用这种方法。

TOP



Re: 【求助】各位大侠,帮忙啊

当引物差的时候扩增效率很低的情况下,可以试一试touch downPCR ,可以有效地提高扩增效率,增加引物扩增特异性!

TOP



Re: 【求助】各位大侠,帮忙啊

将你的引物长度延长至40nt左右,效果可能会好一些。

TOP



Re: 【求助】各位大侠,帮忙啊

谢谢大家啊,我按你们的方法去试试,这里真好。

TOP



Re: 【求助】各位大侠,帮忙啊

    建议楼主如果试验成功可以回帖描述成功经验与大家分享哦

TOP



Re: 【求助】各位大侠,帮忙啊

不好意思啊,最近实验忙,都没上来了。我把上述大家提供的建议综合了一下,即第一轮做了个touch down,以第一轮产物为模板,二次PCR时选择了较高的退火温度,出来结果了。测序也是我要的片段。谢谢大家!

TOP



Re: 【求助】各位大侠,帮忙啊

   恭喜恭喜!

TOP



Re: 【求助】各位大侠,帮忙啊

恭喜!

TOP

发新话题