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【求助】求助:关于基因模板问题


武林三国

【求助】求助:关于基因模板问题

大家好!我最近要做人IL-1(白细胞介素-1),现设计了引物,以oligo(dT)反转录的人总cDNA,结果没扩出来。想不明白,为什么人的总cDNA会没有这个基因啊?
注明:其他方面都是没有问题的,都检查过了,模板也能扩出其他的基因。


 IL-1是一种单核因子, 主要由单核细胞、巨噬细胞产生。人IL-1 aIL-1 B分别由159 153 个氨基酸组成, 分子量为1715kDa, 基因定位于2 号染色体。IL-1 的主要生物学功能为: ①促进胸腺细胞、T细胞的活化、增值和分化; ②刺激造血细胞和成纤维细胞产生集落刺激因子(CSF) , 增加造血细胞CSF 受体的数量并协同CSF 促进造血细胞功能。


请各位XDJM多多帮助指教!谢谢了!

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Re: 【求助】求助:关于基因模板问题

    楼主,如果像你所说其他方面都没有问题,那么会不会是你的PCR体系呢?比如温度,Mg离子等,你需要优化条件不!要不就是你的引物的问题!论坛内有很多关于引物的帖子,同样也有很多关于PCR扩增的帖子!
     不能因为可以扩增出其他东西就确定自己要做的这个基因没有问题,不同的基因有不同的要求的!这个需要自己摸索的哦!

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武林三国

Re: 【求助】求助:关于基因模板问题

谢谢binbintt 的应助!

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Re: 【求助】求助:关于基因模板问题

lily,不知道你的“人总cDNA”是怎样一个体系,是“人总cDNA文库”吗??

一个蛋白分子的表达量决定了它的cDNA在文库中的丰度(其实是反之——即后者决定前者,只是我们一般先检测蛋白),从理论上来讲,这个蛋白在哪种细胞或组织中表达,就选取该种组织或细胞提取RNA,行RT-PCR。如果你用的“人总cDNA文库”,最好是原始的文库,如果是扩增过之后的,很难保证里面的成员不丢失。

结合自己的情况,分析一下。

祝顺利

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武林三国

Re: 【求助】求助:关于基因模板问题

      同意楼上兄台建议,因为不同基因的表达丰度是不同的,你首先还要确定你所抽提的RNA是否是你的目的基因表达丰度最高的组织,只有抽提到表达丰度最高的组织才更容易扩增到你的目的基因!
      因此我想楼主还是应该考虑这个重要的问题。
      祝试验顺利!

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Re: 【求助】求助:关于基因模板问题

不好意思,最近实验忙,好久没来了,多谢大家的指导,实验证明楼上两位的知道完全正确,我开始用的是人睾丸组织CDNA,里面针对IL-1的丰富应该是很低的,后来我从外周血白细胞来提RNA反转录的,结果有扩出,有时自己遇到不太清楚的实验,我觉得在上面发贴求助是一种很好的方法,有高手指点。 非常感谢!

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武林三国

Re: 【求助】求助:关于基因模板问题

   恭喜恭喜,酷友通过求助使得自己试验顺利完成,这是每位genecool成员高兴得事情。也希望酷友能大力帮忙宣传,让我们的大家庭更加壮大!

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