威望、酷币、资源币获取方法及用途
基因酷保藏中心资源获取规则
保藏中心资源获取流程详细说明
基因酷保藏中心资源进出明细
领取红包获得资源币和威望
各版诚拜版主,每版欲聘5名
生物科研网址导航使用说明
生物科研网络助手使用说明
基因酷资源免费,望您点击广告
来支持基因酷
基因酷大事件回顾
论坛使用说明及酷友指南
基因酷FTP的使用及说明
基因酷个人空间(博客)使用帮助
邀请您参与《生物信息学分析系列图书》编写
祝贺酵母共享平台的建立,征集细胞株共享实验技术支持!
科研文献、资料分享交流倡议
基因酷网络资源调整公告!
情系灾区,奉献爱心
发新话题
打印

【话题讨论】高通量测序



【话题讨论】高通量测序

先转载一篇生物通的文章:
454测序技术出产Nature、Science文章
CuraGen  Corporation公司(NASDAQ:  CRGN)旗下拥有其多数股权的子公司454  Life  Sciences公司11月15日宣布,他们利用454  SequencingTM将穴居人DNA序列与人类、黑猩猩的基因组序列进行比对,发现现代人类和穴居人祖先在距今大约50万年以前分道扬镳,并且他们共同祖先的population的有效大小(effective  size)与现代人类的population的有效大小相差无几。研究结果刊登于Nature杂志,文章题目为《Analysis  of  one  million  base  pairs  of  Neandertal  DNA》。

        马克斯-普朗克协会进化人类学研究所(Max  Planck  Institute  for  Evolutionary  Anthropology)所长Svante  Pääbo说:直接对穴居人化石样本中提取的DNA进行高通量454测序,测序结果成为穴居人基因组(包括与人类核DNA序列相似的一百万对碱基)研究的一项重要组成部分,我们对穴居人全基因组进行测序的信心更加坚定了。对穴居人基因组进行测序,为鉴别现代人(解剖学定义)基因组特异遗传变化提供了独到的帮助。

        关于相同穴居人化石样本的一篇平行报道也刊登于本周Science网络版。Pääbo在Science文章说:“实验过程包括传统的建库(library  preparation,生物通编者译)步骤,90%以上的碱基对都经过454测序。”

        “能在Nature和Science上发表文章,是对454测序技术的进一步肯定,说明我们逐步成为广泛、快速、准确测序任何基因组,甚至已经发生高度降解的样本的基因组的金标准,”454    Life  Sciences公司CEO  Christopher  McLeod说,“我们相信与测序任何个体人类基因组相比,穴居人基因组研究结果能够为人类生物学带来更多的发现。”

        由于细菌DNA对化石样本的污染,测序穴居人基因组与测序人类基因组相比,需要做的工作更多。454  Life  Sciences公司研制的Genome  Sequencer  20  系统克服了这一障碍,一台  Genome  Sequencer  20能够在五小时内,对小量骨化石中的约25万单一DNA序列进行测序。所确定的DNA序列长度为100-200bp,古DNA片段(ancient  DNA  fragments)长度恰好吻合。

        穴居人测序小组今后两年中打算绘制30亿个碱基对组成的穴居人基因组草图,中期目标是完成穴居人线粒体基因组测序,以对“穴居人母体DNA对现代人类DNA有无捐献”这个问题做出回答。

TOP



Re: 【话题讨论】高通量测序

据说454测序仪现在每个反应已经能够测定3000万个序列以上了(仪器设有8通道,每通道一次反应可测定400万个序列),虽然由于一些技术形成了瓶颈,暂时测定序列的长度有限,大约40bp需要暂停一次,但是想想,这个技术如果成熟,我们人类基因组计划原来花费的长时间,现在好像只需要很短的时间就能搞定。 现阶段这个技术花费比较大,大约一个反应要3000-4000美金,但相关行业内已经形成一个共识,近期的目标是1000美金能完成对一个人的基因组全序列测定,这个目标一旦实现......(请大家讨论吧) 高通量测序现在融合了计算机、纳米PCR等相关技术,本人只懂得一小半,如果能有谁讲解下这个技术就好了

TOP



Re: 【话题讨论】高通量测序

“1000美金能完成对一个人的基因组全序列测定” 这个目标要是能实现的话,对于各种基因突变导致的疾病岂不是一目了然?对于各种导致表型变化的基因型变化也是手到擒来...上游的很多工作都会简化了。 技术革新对科学的推动真是不容小觑。

TOP



Re: 【话题讨论】高通量测序

对于人类起源问题的探讨一直是个热点,新的发现也是越来越多。

TOP


kankan
fei 风   

TOP

发新话题