关于稳定转染真核细胞的鉴定(即外源基因在真核细胞的表达)——
一些个人体会(原创)
引言:既然提倡原创,而且风也放出来了,那就赶紧实施吧,呵呵!
以前的实验过程中,做过几次真核细胞的稳定转染。幸亏当时有高人指导,少走了不少弯路,印象很深。现在把自己的实验体会和大家分享一下,希望碰到类似问题的酷友们可以从中借鉴。夫才疏学浅,如有疏漏、寡闻之处,敬请拍砖。
真核细胞稳定转染的实验周期较长,从构建载体、转染、筛选单克隆、扩大培养直到鉴定,加起来个把月的时间就扔进去了。而且更重要的是后续实验的延续性,只有对转染细胞的质量进行严格控制,才能满足实验的需要。因此,对转染细胞的鉴定是很慎重的问题,常用的方法有:
1. Western blot(蛋白水平,首选)
利用Western blot技术,对转染后细胞内是否有目的蛋白X的表达进行检测。这里,需要设置好阴性对照和阳性对照。举例说明:例如,我的载体里面有HIS-tag标记,那我就可以用HIS-tag抗体检测细胞中目的融合蛋白X-HIS的表达情况。当然,如果手里有针对目的蛋白X的抗体那就更方便了,直接用它就可以了。
阴性对照:稳定转染空载体的细胞的裂解液
阳性对照:表达X蛋白的细胞;或者体外表达X蛋白的大肠杆菌的菌体裂解液
在进行SDS-PAGE的时候,将实验组,阴性对照,阳性对照同时在一板胶上电泳,然后转印、杂交、显影。最理想的结果是:阴性对照无带;而实验组和阳性对照出现与目的蛋白X分子量相近的条带,且二者位置相当(当然,如果检测的是融合蛋白,则融合蛋白分子量=目的蛋白X的分子量+Tag的分子量)。
2. RT-PCR(mRNA水平)
通过RT-PCR检测目的基因X的转录情况。在进行扩增时要注意设置阴性对照和阳性对照。
阴性对照:RT反应时,将反转录酶用ddH2O代替,其余成分同实验管,同时进行反转录反应后,用PCR反应观察能否扩增得到目的片段。
阳性对照:以表达该目的基因X的细胞作为RT反应的RNA来源,同法进行RT-PCR;或者以含有目的基因片段的质粒DNA作为PCR模板,进行PCR反应。
在将PCR产物进行电泳的时候,将实验组,阴性对照,阳性对照同时在一板胶上电泳,最理想的结果是:阴性对照无带;而实验组和阳性对照有相应大小的DNA片段出现,且二者位置相当。
但是,切记鉴定实验不是就此结束了,还有一个重要的实验:测序!!如果不经过测序的验证就直接下结论说细胞里有X基因的表达,未免有些武断。(个人的感觉是:RT-PCR的结果若不经测序验证,心中惴惴不已,何谈信心去做下一步实验。)
3. 其他
如原位杂交,免疫荧光,免疫细胞化学,活细胞GFP观察等则见仁见智,各位酷友可以在文献中search看看!