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[PCR资源共享] 重叠PCR原理讲解



重叠PCR原理讲解

因为要做重叠PCR,找了些相关资料,兹与大家分享,希望有用。



重组PCR的应用是非常广泛的,他的原理其实很简单:比如说有两个基因或者说一个启动子和一个基因,你要将他们连接到一起,我们首先想到的方法当然是借助于酶切的方法,但有时我们并不一定能构找到合适的酶切位点,或者说我们找到了酶切位点,但这种酶非常特殊或者又很贵,我们可能只用一次,这样购买酶就变成了一种浪费,难道没有别的办法了吗?当然有,那就是重组PCR技术。举个例子可能更容易说明。比如两个基因,一个命名为A,一个命名为BA的序列为5-atgcatgctagctagaacgctacgctgactaccccctgatc-3B的序列为5-atgctagtagctagccccccccaggggataattttttaaaacg-3。首先我们要设计引物,假设引物的序列为:

A1:5-ATGCATGCTAGCTAGAACGCT-3
A2:5-ggggggctagctactagcatgatcagggggtagtcagcgt-3

B1:5-acgctgactaccccctgatcatgctagtagctagcccccc-3
B2:5-cgttttaaaaaattatcccct-3
我们的目的是将基因A,B通过PCR的方法连接起来,我们可以仔细的观察上面的引物A2B1,我们会发现这两条引物要比另外两条引物长很多,为什么会这样呢?这就是我们在设计引物的时候在A23端加入了20B基因5端的序列,在B15端加入了20A基因3端的序列。我们来看重组PCR的步骤:
1)以A1,A2扩增A基因,B1B2扩增B基因
2)回收AB基因
3)以AB为共同的模板,A1B2为引物,扩增A+B,这样我们就利用重组PCR的方法将A+B拼接起来了。为什么会扩出AB呢?因为我们在设计引物的时候使AB有了20个互补的碱基,他们可以经过退火结合在一起,因此可以扩增出A+B.
第三步目前很多人的做法都不同,有的人是先加入模板ABdNTPBuffer,水,然后进行35个循环的扩增,然后在加入引物A1B2以及TAQ酶,这样做的好处是可以得到特异的扩增,缺点是麻烦。另外一种方法是将引物,双模板,酶,dntp等所有的反应成分均一起加入PCR管,进行反应,好处是节省时间,不太麻烦。
目前重组PCR的应用十分广泛,比如说在基因的定点突变,虽然说现在有很多的突变试剂盒,应用起来也很简单,但那是需要银子的;人工合成基因,其实人工合成基因最基本的技术(目前应用最为广泛的)就是利用重组PCR的方法;启动子与目的基因的串连;两个不同表达盒的连接,大家都知道我们在使用DNA调取或者说扩增基因的时候,往往需要将几个表达盒串连起来观察他们的表达效果,但由于绝大多数的DNA中都含有内含子,也就是说几个外显子并不是串连在一起的,而要想达到我们的目的,只要应用重组PCR技术就可以轻松完成。





以引物A/B进行PCR1
2)  
以引物C/D进行PCR2
3)  
引物B/C中引入了需要的限制性位点;
4)  
混合二者PCR产物,混合以前最好回收一下;
5)  
进行PCR延伸反应,只有右面这个可以延伸;
6)  
以延伸反应的产物为模板,以A/D为引物进行PCR
7)  
产物即为所需最终产物。


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  • tieniu03 威望 +1 资源分享 08-9-13 09:20
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