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[蛋白质纯化与鉴定]
救助解答不表达的原因
lucysuper
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发表于 08-7-30 16:18
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救助解答不表达的原因
各位高手,我用
pGEM-6p-1表达IHNV的G蛋白,跑SDS-PAGE就是没有表达,我该怎么办啊?
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lucysuper
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gaohua_1921
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发表于 08-7-30 21:33
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确定一下你的目的片段是否连接到表达载体上
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lichuan04
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发表于 08-7-31 09:37
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pGEM?应该是pGEX-6p-1吧
1.构建是否有问题-----外源基因插入与否,读码框架是否正确; 解决方案:测序验证一下
2.表达过程是否有问题-----诱导了吗,诱导时期是否最佳,IPTG是否失效,空载体表达GST了吗; 解决方案:设立空载体的对照
3.蛋白样的处理是否有问题-----诱导后菌液如何处理的,蛋白样如何制作的; 解决方案:向实验室前辈请教
祝顺利!
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hamye
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hamye
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发表于 08-7-31 11:42
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做这种试验,过程要严谨,比如测序等都不要省。
还有,要想快速找到原因,实验中设置各种对照是最快的方法。
众人争官打破头,学术不过是耍猴;溜须拍马不算狗,诚实做事才下流
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lucysuper
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发表于 08-8-1 10:08
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感谢各位的解答。
对照以上各位的支招,
1,测序正确,目的片段插入载体。
2,IPTG是诱导前才配的,并且同时其他人用这批IPTG诱导出了他们的目的蛋白。
3,蛋白样制作按照操作指南,没有问题。
只是没设空载体对照,下一步设对照。
因为是病毒的膜蛋白,全长表达可能有细胞毒性,如何知道是因为细胞毒性导致的不表达,各位有高招吗?谢谢!
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nano
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发表于 08-8-3 09:28
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膜蛋白表达相对较难,你应该选用融合TAG较长的载体,N端的TAG可溶性可以降低由目的基因毒性产生问题的可能性,pGEX-6p-1没用过,具体情况不清楚。尽量选用严谨型的菌株和载体,避免泄露表达,同时可以试试STUDIER的自诱导培养基控制泄露表达,并建议从转化表达菌株就开始使用此文中的培养基
http://www.genecool.com/bbs/thread-118-1-1.html
如果是因为细胞毒性导致不表达,则必然已经有少量的蛋白已经表达,可以从RNA和蛋白上入手检测看看泄露表达情况,但是个人认为为了一个克隆去做这些好像太费劲了
有生物信息学办法预测细胞毒性,好像是预测跨膜结构,具体的情况不熟悉,自己也没学好,呵呵
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小宝
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发表于 08-8-4 07:14
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膜蛋白一般具有疏水区,这种疏水区会影响蛋白表达量的。
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lichuan04
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发表于 08-8-4 16:37
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pGEX-6p-1系列的TAG为26KDa的GST,还算比较大了,由此表达的融合蛋白常在表达量和可溶性上有所增强,是一株居家旅行,馈赠亲友的必备良品........
目前的推测是你的蛋白是有可能是胞毒性的,一旦表达少量即终止表达,这种现象在我们实验室遇到过,当时也是非常纳闷为什么不表达,因为测序和表达框架都对。后来查文献发现一篇外文文献有讲,这种情况下即使有少量表达,PAGE也分辨不出来,于是后来做了个截短表达,顺利地表达了一部分,希望对你的实验有参考
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发表于 08-8-8 12:08
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设空载体对照的结果,有GST表达,很大可能是蛋白有细胞毒性。因为我们后期工作的目标是该蛋白的疏水区,截短是不可取的。各位高手,如何克服有细胞毒性的蛋白原核表达,有没有个好办法啊?
[
本帖最后由 lucysuper 于 08-8-8 12:10 编辑
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lucysuper
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nano
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发表于 08-8-8 22:32
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一个原则,避免泄露表达
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