基因酷生物信息版从成立到现在，始终朝着一个目标发展，就是为广大生物信息学爱好者提供一个交流的平台和资源，虽然这一过程并不总是快乐的，有些坎坷,但是当看到大家因论坛而受益，我们深感欣慰。众所周知，基因酷论坛精英荟萃，而论坛有其平台优势，因此这次论坛打算利用这个优势为大家提供一个发展机会，组织论坛会员开展一些图书的出版项目，书的
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Raindyok@126.com
书暂定名：
《生物信息学分析实践》或
《生物信息分析实例》
主 编：未定
编 委：Downsea、Raindy、Soofree、Lily、言午、二马、孤风逐日、庄军、盖永华＋期待
你的加入...
编委档案：略
暂定目 录：如下
引用:
序
第1章 生物信息学简介
第2章 数据库搜索
Entrez-NCBI、SRS-EBI、BIOMART、BLAST
第3章 引物设计及测序结果分析
第一节 引物设计
3.1.1引物分析概述
3.1.2 引物分析流程：引物设计的原则、引物质量的评价
3.1.3引物分析软件：Primer Premier 5.0、Oligo6.03
3.1.4 引物分析示例
本地化软件：Primer Premier 5.0(设计引物) ＋ Oligo6.03(引物质量评估)
在线工具：ligonucleotide Properties Calculator＋ Oligo Calculator(引物质量评估)
第二节 序列拼接
3.2.1 拼接简介
3.2.2 序列拼接实例：DNAMAN＋ VectorNTI中的ContigExpress＋DNAstar中的Seqman
第三节 测序结果分析Chromas（查看峰图）－实例分析
第4章 核苷酸序列分析
第5章 氨基酸序列分析 是否56两章合并？
5.1理化性质分析
5.2功能域分析
5.2.1 疏水性
5.2.2 跨膜区
5.2.3信号肽
5.2.4 Coil区
5.2.5低复杂度区
5.2.6 Domain
5.3功能位点分析(基序分析或Motif搜索)
第6章 蛋白质空间结构
6.1空间结构预测
6.2二级结构预测 PHD
6.3三级结构预测
6.3.1同源模建
6.3.2折叠识别
6.3.3从头预测
第7章 系统发育分析
7.1系统发育分析简介：定义、原理
7.1.1建树方法与流程：NJ法、ML法、MP法的原理、优缺点、选择原则
7.1.2 建树工具：PAUP、PHYLIP、MEGA、、TreeView
7.1.3建树分析示例
PAUP建树＋MEGA构建NJ树＋PHYLIP建ML树＋MrBayes建ML树
第8章 抗原决定簇预测 是否有必要？
8.1简介
8.2分析示例
8.3肽段选择原则
第9章 RNA分析
9.1简介
9.2RNA二级结构
9.3MicroRNA分析
第10章 参考文献管理
10.1简介
10.2三大软件实例分析
10.2.1Endnote
10.2.2ReferenceManager
10.2.3NoteExpress
第11章 生信编程
：
2008年7-8月 逐步整理，确定编写内容、人员、分工，
2008年9月 各成员自行安排写作
2009年1-2月 完成初稿，上交
插图要求：详见附件
目前粗分工：引用:
Downsea：
个人简介待整理...
参与章节：第2章 数据库搜索 第11章 生信编程
Raindy：
个人简介待整理...
参与章节：第5章 氨基酸序列分析 3.1.4 引物设计实例 7.1.3建树分析示例
Soofree：
个人简介待整理...
参与章节：第1章：生物信息学简介
Lily：
个人简介待整理...
参与章节：第4章中的基因结构分析
言午：
个人简介待整理...
参与章节：10.2.1Endnote
二马：
个人简介待整理...
参与章节：3.1.4 引物分析示例
孤风逐日：
个人简介待整理...
参与章节：第7章 系统发育分析
庄军：
个人简介待整理...
参与章节：引物设计及测序结果分析
盖永华：
个人简介待整理...
参与章节：第7章 系统发育分析
引用:
第4章 核苷酸序列分析
第6章 蛋白质空间结构
第8章 抗原决定簇预测 是否有必要？
第9章 RNA分析
9.1简介
9.2RNA二级结构
9.3MicroRNA分析
第10章 参考文献管理
10.1简介
10.2三大软件实例分析
10.2.2ReferenceManager
10.2.3NoteExpress
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本帖最后由 Raindy 于 08-7-7 11:23 编辑 ]
