各位大侠，我让生物公司合成目的基因加酶切位点HindⅢ和XbaⅠ克隆入pUC18，双酶切后和真核表达载体构建成重组子。但是生物公司把酶切位点HindⅢ合成错了。HindⅢ是最后一个内切酶，如果重新选择其他内切酶，切下来的片段就要带有原核表达原件，这样再和真核表达载体连接成的重组体转染动物会不会出现问题啊？我选择的真核表达载体是pcDNA3.1/myc-hisB请各位大侠指点一下，谢谢！

根据pcDNA3.1 MYC HIS B的MSC（见附图）,可以看出，Hind3 的位点位于MCS起始的第一个位点，Xba1位于下游。根据你的情况，只能从Hind3 和Xba1之间的几个酶切位点（即Kpn1，BamH1，BstX1，EcoR1，EcoR5，Not1，Xho1）去做选择。现在的问题首先应该是可不可行，即你能从pUC18载体上面找到合适的酶切位点（即Kpn1，BamH1，BstX1，EcoR1，EcoR5，Not1，Xho1）吗？因为从你给的pUC18的图谱上看，似乎没有看到有合适的位点。
当然，如果确实能找到合适的酶切位点的话，可以再继续讨论是否影响表达的问题。

其实，如果允许的话，不如重新合成一个引物，再做一个亚克隆就行了，也不费什么事。

我选择的是EcoR1和Xba1。将目的基因克隆入pUC18后，pUC上可以选择的酶切位点只有BamH1,Sma1，Kpn1，EcoR1，Sac1，其中Kpn1和EcoR1在pcDNA3.1 MYC HIS B上都有，你看对不对？

如果你的目的基因是用HindⅢ和XbaⅠ克隆入pUC18的，那么你如果用EcoR1和Xba1去切的话，只会切到pUC18载体上EcoR1和Xba1之间的片段，这里没有你的目的基因的，所以是不会把目的基因切出来的。