威望、酷币、资源币获取方法及用途
基因酷保藏中心资源获取规则
保藏中心资源获取流程详细说明
基因酷保藏中心资源进出明细
领取红包获得资源币和威望
各版诚拜版主,每版欲聘5名
生物科研网址导航使用说明
生物科研网络助手使用说明
基因酷资源免费,望您点击广告
来支持基因酷
基因酷大事件回顾
论坛使用说明及酷友指南
基因酷FTP的使用及说明
基因酷个人空间(博客)使用帮助
邀请您参与《生物信息学分析系列图书》编写
祝贺酵母共享平台的建立,征集细胞株共享实验技术支持!
科研文献、资料分享交流倡议
基因酷网络资源调整公告!
情系灾区,奉献爱心
发新话题
打印

[版务管理] pMDC30载体序列及图谱

本主题由 小宝 于 08-7-23 11:42 移动 

pMDC30载体序列及图谱

如题,想要获得pMDC系列的图谱,酵母表达系统用的。
有的朋友请帮忙发下,谢谢了。例如pMDC30

[ 本帖最后由 wcg129 于 08-6-17 15:22 编辑 ]

TOP



pMDC30载体图谱

载体名称:pMDC30


载体图谱:



载体序列及特征:



酶切位点分析(dnaman):

Restriction analysis on pMDC30
Methylation: dam-No dcm-No

Screened with 117 enzymes, 364 sites found
AatII  GACGT/C  1:   10246
Acc65I  G/GTACC  1:   2056
AccIII  T/CCGGA  4:   1576, 9371, 9507, 10044
AclI  AA/CGTT  2:   1487, 4688
AflII  C/TTAAG  1:   219
AgeI  A/CCGGT  2:   6257, 9927
AhaIII  TTT/AAA  10:   1317, 1656, 2202, 2636, 2713, 6323, 7980, 8009, 8376, 8536
Alw44I  G/TGCAC  5:   672, 6790, 7288, 9683, 9985
AlwNI  CAGNNN/CTG  4:   800, 4503, 4571, 7390
ApaBI  GCANNNNN/TGC  5:   5219, 6799, 8818, 9692, 9968
ApaI  GGGCC/C  1:   2054
ApaLI  G/TGCAC  5:   672, 6790, 7288, 9683, 9985
AscI  GG/CGCGCC  1:   2035
Asp718I  G/GTACC  1:   2056
AsuII  TT/CGAA  1:   2326
BalI  TGG/CCA  8:   584, 680, 1309, 3146, 4694, 4961, 5428, 6374
BamHI  G/GATCC  5:   1119, 1822, 2065, 2077, 2398
BbeI  GGCGC/C  1:   6552
BbvII  GAAGACNN/  9:   10465, 10792, 2170, 2844, 8012, 10468, 10693, 10795, 11020
BclI  T/GATCA  1:   8691
BglI  GCCNNNN/NGGC  10:   2578, 3018, 3404, 3638, 3826, 3838, 3847, 4700, 5113, 5425
Bpu1102I  GC/TNAGC  1:   8084
Bsc91I  GAAGACNN/  9:   10465, 10792, 2170, 2844, 8012, 10468, 10693, 10795, 11020
BsiI  C/TCGTG  5:   7147, 10497, 10824, 9686, 10165
BsmI  GAATGCN/  7:   2589, 4935, 1178, 1585, 5612, 7698, 8592
Bsp1407I  T/GTACA  3:   326, 728, 2011
BspHI  T/CATGA  1:   8234
BspMI  ACCTGCNNNN/  5:   457, 2417, 5617, 6011, 9952
BspMII  T/CCGGA  4:   1576, 9371, 9507, 10044
BssHII  G/CGCGC  4:   24, 48, 1078, 2035
BstD102I  GAG/CGG  7:   3387, 6907, 11286, 287, 6473, 9520, 9878
BstXI  CCANNNNN/NTGG  3:   276, 592, 11087
ClaI  AT/CGAT  1:   5843
Csp45I  TT/CGAA  1:   2326
CspI  CG/GWCCG  1:   9858
DraI  TTT/AAA  10:   1317, 1656, 2202, 2636, 2713, 6323, 7980, 8009, 8376, 8536
DraIII  CACNNN/GTG  2:   9691, 9984
DrdI  GACNNNN/NNGTC  6:   6669, 7082, 9386, 9767, 10742, 11069
EagI  C/GGCCG  20:   282, 1892, 3081, 3309, 3313, 3639, 3743, 4117, 4193, 4654, 5171,
       5417, 5520, 5667, 5740, 5856, 6461, 9325, 9895, 10060
Ecl136II  GAG/CTC  1:   266
Eco31I  GGTCTCN/  2:   6166, 563
Eco52I  C/GGCCG  20:   282, 1892, 3081, 3309, 3313, 3639, 3743, 4117, 4193, 4654,
       5171, 5417, 5520, 5667, 5740, 5856, 6461, 9325, 9895, 10060
Eco56I  G/CCGGC  16:   3083, 3257, 3307, 3311, 3338, 3837, 4195, 4512, 4652, 4741,
       4987, 5208, 5415, 5419, 5564, 6545
Eco57I  CTGAAGNNNNNNNNNNNNNNNN/  4:   3875, 4784, 7522, 2613
EcoICRI  GAG/CTC  1:   266
EcoNI  CCTNN/NNNAGG  1:   6076
EcoRI  G/AATTC  1:   1572
EcoRV  GAT/ATC  2:   7811, 10435
EheI  GGC/GCC  1:   6550
EspI  GC/TNAGC  1:   8084
FseI  GGCCGG/CC  3:   3315, 3841, 5419
HindIII  A/AGCTT  1:   2423
KpnI  GGTAC/C  1:   2060
Mlu113I  CC/GCGG  2:   273, 8686
MscI  TGG/CCA  8:   584, 680, 1309, 3146, 4694, 4961, 5428, 6374
MstI  TGC/GCA  2:   2568, 5980
NaeI  GCC/GGC  16:   3085, 3259, 3309, 3313, 3340, 3839, 4197, 4514, 4654, 4743,
       4989, 5210, 5417, 5421, 5566, 6547
NarI  GG/CGCC  1:   6549
NcoI  C/CATGG  1:   1271
NdeI  CA/TATG  3:   4308, 6797, 9817
NheI  G/CTAGC  1:   5763
NotI  GC/GGCCGC  5:   282, 1892, 3639, 5171, 6461
NsiI  ATGCA/T  3:   136, 2254, 7700
PacI  TTAAT/TAA  1:   304
PflMI  CCANNNN/NTGG  4:   1347, 2372, 4571, 5435
PinAI  A/CCGGT  2:   6257, 9927
PmeI  GTTT/AAAC  1:   2636
PstI  CTGCA/G  2:   454, 2414
PvuI  CGAT/CG  4:   252, 2549, 9220, 9907
PvuII  CAG/CTG  3:   1676, 2518, 11154
RleAI  CCCACANNNNNNNNNNNN/  2:   6569, 5425
SacI  GAGCT/C  1:   268
SacII  CCGC/GG  2:   275, 8688
SalI  G/TCGAC  2:   444, 2404
SapI  GCTCTTCN/  2:   6858, 6383
ScaI  AGT/ACT  5:   1159, 2228, 2791, 9045, 9299
SciI  CTC/GAG  3:   2043, 9208, 10302
SfiI  GGCCNNNN/NGGCC  5:   3404, 3838, 3847, 5113, 5425
SgrAI  CR/CCGGYG  1:   6545
SmaI  CCC/GGG  3:   705, 2062, 10285
SpeI  A/CTAGT  1:   295
SphI  GCATG/C  1:   2760
SplI  C/GTACG  1:   5647
SrfI  GCCC/GGGC  1:   705
SspI  AAT/ATT  2:   1264, 7738
SstI  GAGCT/C  1:   268
SstII  CCGC/GG  2:   275, 8688
SunI  C/GTACG  1:   5647
Tth111I  GACN/NNGTC  4:   6721, 8848, 9764, 10208
VspI  AT/TAAT  3:   9020, 11146, 11205
XbaI  T/CTAGA  3:   289, 1125, 2071
XcmI  CCANNNNN/NNNNTGG  3:   3167, 4322, 8340
XhoI  C/TCGAG  3:   2041, 9206, 10300
XmaI  C/CCGGG  3:   703, 2060, 10283
XmaIII  C/GGCCG  20:   282, 1892, 3081, 3309, 3313, 3639, 3743, 4117, 4193, 4654,
       5171, 5417, 5520, 5667, 5740, 5856, 6461, 9325, 9895, 10060
XmnI  GAANN/NNTTC  3:   9021, 10475, 10802
XorII  CGAT/CG  4:   252, 2549, 9220, 9907

List by Site Order
24      BssHII      2423    HindIII     4987    Eco56I      8012    Bsc91I
48      BssHII      2518    PvuII       4989    NaeI        8084    Bpu1102I
136     NsiI        2549    XorII       5113    BglI        8084    EspI
219     AflII       2549    PvuI        5113    SfiI        8234    BspHI
252     PvuI        2568    MstI        5171    NotI        8340    XcmI
252     XorII       2578    BglI        5171    EagI        8376    DraI
266     EcoICRI     2589    BsmI        5171    Eco52I      8376    AhaIII
266     Ecl136II    2613    Eco57I      5171    XmaIII      8536    DraI
268     SacI        2636    DraI        5208    Eco56I      8536    AhaIII
268     SstI        2636    PmeI        5210    NaeI        8592    BsmI
273     Mlu113I     2636    AhaIII      5219    ApaBI       8686    Mlu113I
275     SacII       2713    AhaIII      5415    Eco56I      8688    SstII
275     SstII       2713    DraI        5417    Eco52I      8688    SacII
276     BstXI       2760    SphI        5417    XmaIII      8691    BclI
282     NotI        2791    ScaI        5417    EagI        8818    ApaBI
282     EagI        2844    Bsc91I      5417    NaeI        8848    Tth111I
282     XmaIII      2844    BbvII       5419    FseI        9020    VspI
282     Eco52I      3018    BglI        5419    Eco56I      9021    XmnI
287     BstD102I    3081    EagI        5421    NaeI        9045    ScaI
289     XbaI        3081    XmaIII      5425    SfiI        9206    XhoI
295     SpeI        3081    Eco52I      5425    BglI        9208    SciI
304     PacI        3083    Eco56I      5425    RleAI       9220    XorII
326     Bsp1407I    3085    NaeI        5428    MscI        9220    PvuI
444     SalI        3146    BalI        5428    BalI        9299    ScaI
454     PstI        3146    MscI        5435    PflMI       9325    EagI
457     BspMI       3167    XcmI        5520    EagI        9325    Eco52I
563     Eco31I      3257    Eco56I      5520    XmaIII      9325    XmaIII
584     MscI        3259    NaeI        5520    Eco52I      9371    BspMII
584     BalI        3307    Eco56I      5564    Eco56I      9371    AccIII
592     BstXI       3309    XmaIII      5566    NaeI        9386    DrdI
672     Alw44I      3309    EagI        5612    BsmI        9507    BspMII
672     ApaLI       3309    NaeI        5617    BspMI       9507    AccIII
680     BalI        3309    Eco52I      5647    SunI        9520    BstD102I
680     MscI        3311    Eco56I      5647    SplI        9683    ApaLI
703     XmaI        3313    NaeI        5667    Eco52I      9683    Alw44I
705     SmaI        3313    EagI        5667    XmaIII      9686    BsiI
705     SrfI        3313    Eco52I      5667    EagI        9691    DraIII
728     Bsp1407I    3313    XmaIII      5740    XmaIII      9692    ApaBI
800     AlwNI       3315    FseI        5740    Eco52I      9764    Tth111I
1078    BssHII      3338    Eco56I      5740    EagI        9767    DrdI
1119    BamHI       3340    NaeI        5763    NheI        9817    NdeI
1125    XbaI        3387    BstD102I    5843    ClaI        9858    CspI
1159    ScaI        3404    SfiI        5856    Eco52I      9878    BstD102I
1178    BsmI        3404    BglI        5856    XmaIII      9895    XmaIII
1264    SspI        3638    BglI        5856    EagI        9895    Eco52I
1271    NcoI        3639    NotI        5980    MstI        9895    EagI
1309    BalI        3639    EagI        6011    BspMI       9907    PvuI
1309    MscI        3639    XmaIII      6076    EcoNI       9907    XorII
1317    DraI        3639    Eco52I      6166    Eco31I      9927    PinAI
1317    AhaIII      3743    XmaIII      6257    AgeI        9927    AgeI
1347    PflMI       3743    Eco52I      6257    PinAI       9952    BspMI
1487    AclI        3743    EagI        6323    DraI        9968    ApaBI
1572    EcoRI       3826    BglI        6323    AhaIII      9984    DraIII
1576    BspMII      3837    Eco56I      6374    MscI        9985    ApaLI
1576    AccIII      3838    SfiI        6374    BalI        9985    Alw44I
1585    BsmI        3838    BglI        6383    SapI        10044   BspMII
1656    DraI        3839    NaeI        6461    NotI        10044   AccIII
1656    AhaIII      3841    FseI        6461    XmaIII      10060   XmaIII
1676    PvuII       3847    SfiI        6461    Eco52I      10060   Eco52I
1822    BamHI       3847    BglI        6461    EagI        10060   EagI
1892    EagI        3875    Eco57I      6473    BstD102I    10165   BsiI
1892    NotI        4117    EagI        6545    Eco56I      10208   Tth111I
1892    XmaIII      4117    Eco52I      6545    SgrAI       10246   AatII
1892    Eco52I      4117    XmaIII      6547    NaeI        10283   XmaI
2011    Bsp1407I    4193    EagI        6549    NarI        10285   SmaI
2035    AscI        4193    XmaIII      6550    EheI        10300   XhoI
2035    BssHII      4193    Eco52I      6552    BbeI        10302   SciI
2041    XhoI        4195    Eco56I      6569    RleAI       10435   EcoRV
2043    SciI        4197    NaeI        6669    DrdI        10465   BbvII
2054    ApaI        4308    NdeI        6721    Tth111I     10465   Bsc91I
2056    Acc65I      4322    XcmI        6790    ApaLI       10468   Bsc91I
2056    Asp718I     4503    AlwNI       6790    Alw44I      10468   BbvII
2060    KpnI        4512    Eco56I      6797    NdeI        10475   XmnI
2060    XmaI        4514    NaeI        6799    ApaBI       10497   BsiI
2062    SmaI        4571    AlwNI       6858    SapI        10693   Bsc91I
2065    BamHI       4571    PflMI       6907    BstD102I    10693   BbvII
2071    XbaI        4652    Eco56I      7082    DrdI        10742   DrdI
2077    BamHI       4654    XmaIII      7147    BsiI        10792   BbvII
2170    Bsc91I      4654    Eco52I      7288    Alw44I      10792   Bsc91I
2170    BbvII       4654    EagI        7288    ApaLI       10795   BbvII
2202    AhaIII      4654    NaeI        7390    AlwNI       10795   Bsc91I
2202    DraI        4688    AclI        7522    Eco57I      10802   XmnI
2228    ScaI        4694    BalI        7698    BsmI        10824   BsiI
2254    NsiI        4694    MscI        7700    NsiI        11020   BbvII
2326    AsuII       4700    BglI        7738    SspI        11020   Bsc91I
2326    Csp45I      4741    Eco56I      7811    EcoRV       11069   DrdI
2372    PflMI       4743    NaeI        7980    DraI        11087   BstXI
2398    BamHI       4784    Eco57I      7980    AhaIII      11146   VspI
2404    SalI        4935    BsmI        8009    DraI        11154   PvuII
2414    PstI        4961    BalI        8009    AhaIII      11205   VspI
2417    BspMI       4961    MscI        8012    BbvII       11286   BstD102I


Non Cut Enzymes
AvrII       BglII       BstEII      Bsu36I      CvnI        Eam1105I
Eco47III    Eco72I      HpaI        I-PpoI      MfeI        MluI
MstII       NruI        PmaCI       SauI        SnaBI       SpoI
StuI        SwaI
附件: 您所在的用户组无法下载或查看附件
阿巴贡

TOP


谢谢楼上的,呵呵,别人告诉我说这还不是酵母表达用的质粒。我也不知道搞错没有。
非常感谢。

TOP


谢啦!

TOP

发新话题