威望、酷币、资源币获取方法及用途
基因酷保藏中心资源获取规则
保藏中心资源获取流程详细说明
基因酷保藏中心资源进出明细
领取红包获得资源币和威望
各版诚拜版主,每版欲聘5名
生物科研网址导航使用说明
生物科研网络助手使用说明
基因酷资源免费,望您点击广告
来支持基因酷
基因酷大事件回顾
论坛使用说明及酷友指南
基因酷FTP的使用及说明
基因酷个人空间(博客)使用帮助
邀请您参与《生物信息学分析系列图书》编写
祝贺酵母共享平台的建立,征集细胞株共享实验技术支持!
科研文献、资料分享交流倡议
基因酷网络资源调整公告!
情系灾区,奉献爱心
 28 123
发新话题
打印

【求助】菌落PCR模板应该如何加?



【求助】菌落PCR模板应该如何加?

菌落PCR 模板就是直接加1ul的菌液就行了吗?还是先煮沸下,离心取上清好一些?
 
 

TOP



Re: 【求助】菌落PCR模板应该如何加?

煮沸,加1ul。

TOP



Re: 【求助】菌落PCR模板应该如何加?

当然要先煮沸了. 煮沸的目的就是使菌体裂解,释放出可以做为模板的DNA; 当然你也可以反复冻融:-80度数分钟,37度数分钟. 然后离心取上清即可做为模板进行PCR了. 至于加多少量,要看你的菌液浓度了. 如果是以菌体的质粒做为模板还要考虑质粒的丰度了.

多谢您的解答,为表示鼓励,奖励酷币2个。

TOP



Re: 【求助】菌落PCR模板应该如何加?

好像不煮也可以吧 就是在PCR第一循环要94°变性时间稍稍长点

TOP



Re: 【求助】菌落PCR模板应该如何加?

没做过不煮的.

TOP



Re: 【求助】菌落PCR模板应该如何加?

完全不必要额外煮沸。 只需要挑取少许克隆,在配好的PCR反应液中涮几下,然后用正常的PCR反应程序即可。因为在PCR第一个循环94°变性的步骤中(正常设置为4-5min即可),质粒或基因组肯定有释放,也足够PCR反应的模板用量了,这个我每天都在做,还没有做不出的时候。

TOP



Re: 【求助】菌落PCR模板应该如何加?

有空试试.

TOP



Re: 【求助】菌落PCR模板应该如何加?

[quote user="有幸三生"]完全不必要额外煮沸。

只需要挑取少许克隆,在配好的PCR反应液中涮几下,然后用正常的PCR反应程序即可。因为在PCR第一个循环94°变性的步骤中(正常设置为4-5min即可),质粒或基因组肯定有释放,也足够PCR反应的模板用量了,这个我每天都在做,还没有做不出的时候。[/quote]
补充几点如下:
1. 沾有菌落的牙签在PCR反应液中涮过之后,还可以直接扔到LB培养基中用来接种
 
2. 在做菌落PCR的时候,每次都要做阴性、阳性对照,阳性对照可以用抽提好的质粒或基因组,这样可以确定PCR主反应液的配制没有问题,不会因为菌落PCR阴性而怀疑PCR的反应;阴性对照加一点水或者什么都不加,这样可以帮助识别PCR反应是否有假阳性产生的可能;如果偷懒的话,阴性对照可以不做,但阳性对照则是必须要做的
 
3. 再告诉大家一个偷懒的菌落PCR鉴定的方法:按照每次反应15-20 ul的体系计算好PCR各反应组分的量/次,然后一次性配制100次或50次反应的量,做成Ready-to-use的PCR主反应液(除Primers、Taq酶不加,模板用的是菌落),每次做菌落PCR的时候,只需要根据反应的个数,吸取相应的PCR主反应液,补加相应的Primers、Taq酶,再分装即可。这样的好处有二:即开即用,节省时间;另外反应组分均一,可减少实验批次之间的误差。

多谢您的解答,为表示鼓励,奖励酷币2个。

TOP



Re: 【求助】菌落PCR模板应该如何加?

你的方法很独到,值得借鉴。

[quote user="有幸三生"]1. 沾有菌落的牙签在PCR反应液中涮过之后,还可以直接扔到LB培养基中用来接种[/quote]
不过,这样接种会不会有污染啊。

TOP



Re: 【求助】菌落PCR模板应该如何加?

[quote user="小宝"]你的方法很独到,值得借鉴。

 有幸三生 wrote:
1. 沾有菌落的牙签在PCR反应液中涮过之后,还可以直接扔到LB培养基中用来接种

不过,这样接种会不会有污染啊。[/quote]
问题不大,重组质粒一般都含抗性的

TOP

 28 123
发新话题