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推荐生物常用的软件

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荧光定量PCR引物探针庫     中国植物数据庫 
在线--设计引物         中国免疫学信息网 
在线--设计RNAi  
在线--引物库(Primerbank) 
在线--外显子/内含子/SNP查找(Extron/SNP/intron)  
在线--引物同源性比较
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在线--设计多肽 

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软件下载:

Chromas.exe
    ABI格式文件、测序结果的显示与编辑软件。
DnaClub.zip
    DNA Club是一个简单的对DNA进行与PCR有关的操作的软件。它的功能有: 1、输入DNA序列; 2、查找ORF序列; 3、把DNA翻译成蛋白序列; 4、查找酶切位点; 5、查找PCR引物序列。 功能虽然都很简单,但非常实用,一般的用户都可以很方便地使用。

Dnaman.zip
    DNAMAN美国Lynnon Biosoft公司开发的高度集成化的分子生物学应用软件,几乎可完成所有日常核酸和蛋白质序列分析工作,包换多重序列对齐、PCR引物设计、限制性酶切分析、蛋白质分析、质粒绘图等。该软件是所有生物信息学研究人员所必备的,强烈推荐使用!!

Primer5.0
    Primer Premier5.0是由加拿大的Premier公司开发的专业用于PCR或测序引物以及杂交探针的设计和评估的软件,和Plasmid Premier2.02一起是该公司推出的最新的软件产品。其主要界面同样也是分为序列编辑窗口(Genetank),引物设计窗口(Primer Design),酶切分析窗口(Restriction Sites)和Motif分析窗口。这里我们主要介绍其引物设计功能,顾名思义,该软件就是用来进行引物设计的。可以简单地通过手动拖动鼠标以扩增出相应片段所需的引物,而在手动的任何时候,下面显示各种参数的改变和可能的二聚体、异二聚体、发夹结构等。也可以给定条件,让软件自动搜索引物,并将引物分析结果显示出来。而且进行这些操作非常简单。其功能绝不在Oligo 5.0之下!(该软件暂时不提供下载)
 
Oligo6.0     引物分析著名软件,主要应用于核酸序列引物分析设计软件,同时计算核酸序列的杂交温度(Tm)和理论预测序列二级结构。

Beacon Designer 2
    实时荧光定量PCR分子信标(Molecular beacon )及TaqMan探针设计软件 (注:如需要破解,请来信告知机器号,闪晶生物可以提供激活码。(该软件暂时不提供下载)

Primer Express2.0 
    这是ABI公司销售附送的软件,可用于设计引物和探针,尤其适用于荧光PCR探针的设计,可以精确计算寡核苷酸与荧光基团鳌合后的Tm值。可以预测引物与引物之间与模板之间等的二级结构。(该软件暂时不提供下载)
荧光探针Tm值的计算程序      做荧光定量PCR时,对Tm值的判断始终是困扰大家的一个问题,闪晶生物为大家提供一个十分精确的计算程序,操作简单方便。用户可以自己方便地输入各种盐离子浓度。

http://www.shinegene.org.cn
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真是雪中送炭呀!
楼主有大鼠的SNP库吗?谢谢

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真是雪中送炭呀! 感谢楼主!

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