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[数据库及其应用] FASTA格式的疑问



FASTA格式的疑问

在向ncbi提交基因全序列时,要用FASTA 格式,我的是sequin 软件
我看到这个软件的中文说明中有:

核酸:>ID [org=scientific name] [strain=name][clone=name] title


请问前辈们,这个ID是怎样获得的?

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怎么没有人回答呢?我想知道什么是FASTA格式
我是菜鸟,请多指教!!!

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引用:
原帖由 蓝格盈盈 于 08-7-23 20:08 发表
怎么没有人回答呢?我想知道什么是FASTA格式
FASTA格式又称Pearson的格式,该种序列格式要求序列的标题行以大于号">"开头,下一行起为具体的序列。一般建议每行的字符数不超过60个,以方便程序处理。多条核苷酸序列格式即将该格式连续列出即可,具体见下表:
单一核苷酸序列的FASTA格式:
>seq
CAAGGCTGCTGTCACTAGCCTGTGGGGCAAGGTGAATGTGGAAGATGCTGGGGGAGAAAC

多条核苷酸序列的FASTA格式:
>seq1
CCTTGACCAATGACTTTCAAGTACCACGGAAAACAGGGGGGCAGAACTTCAGCAGTAAAG
>seq2
CCTTGACCAATGACTTTTAAGTACCACGGAAAACAGGGGGGCAGAAGTTCAGCAGTAAAG
>seq3
CAGACCTTCTGTCCGCCAGCTGAGAAGGACGAGCGAGAAAGGCAGCTGCGCAGGGGAGTG
........
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  • 纤夫 威望 +1 精彩解答 08-7-24 10:12
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