我的蛋白表达用的是pgex-3x载体， 目的蛋白以包涵体形式表达，用强酸（ph＝2)能溶解包涵体
我现在想要做的是，先用盐酸溶解包涵体，再超滤离心浓缩，然后用缓冲液（factor xa酶切缓冲液）稀释
浓缩液，加factor xa酶水解去除GST融合标签！
           请问我这样做可行不？
           再就是我想问的是factor xa 能不能水解变性的蛋白？ 是不是非要先将包涵体目的蛋白复性后才
可以用factor xa酶切去除融合标签。

强酸（ph＝2)会不会对你的目的蛋白以及Xa有破坏作用呢？
建议楼主还是把蛋白复性之后，用xa推荐的标准溶液，或者比较温和的溶液（例如PB）来做。
需要结合你的目的蛋白的特点，Xa的反应条件，以及目的蛋白纯化之后的用途来综合考虑。