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[其它PCR疑难问题] 已经获得中间片段,怎么扩增上下游片段?


武林三国

已经获得中间片段,怎么扩增上下游片段?

现在我要扩增一个基因,而该物种这个基因序列是未知的,通过同源序列比较,设计兼并引物已经获得了731bp(总长为1092bp),想请教各位达人怎么扩增上下游的未知序列?我现在的操作是这样的:
1.限制酶部分酶切总DNA
2.酶切产物加热失活(也试过纯化回收)
3.酶切产物与含有相应限制酶粘性末端的接头T4连接酶16度连接;
4.连接产物作为模板,接头中的一条单链match(见附件)为引物之一,另外一条引物为根据已获得的731bp设计的P2去扩增上游序列(扩增下游用引物match,P3),进行PCR

可是不管怎么做,已经试过四种限制酶,也摸索过pcr的条件,可还是没有任何条带,想请教哪位高人知道我的实验到底是哪一步出了问题?还有除了RACE,反向PCR还有什么办法扩增全长序列,因为小实验室老板舍不得买RACE的试剂盒,愁死了
附件: 您所在的用户组无法下载或查看附件

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怎么没人呢?自己顶一个吧

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武林三国
楼主要扩增的1092bp是DNA序列还是RNA序列?
生命诚可贵,实验价更高。

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要扩增的是DNA ,而且没有内含子

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武林三国
Takara 有Genome Walking kit,应该可以实现楼主的目的。附件里的文献不知道有么有用,楼主可以看看。

[ 本帖最后由 纤夫 于 08-5-16 15:44 编辑 ]
附件: 您所在的用户组无法下载或查看附件
生命诚可贵,实验价更高。

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谢谢纤夫的答复!哪里附件的文献呢?没看到啊

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武林三国
现在好像论坛有些问题,请等待一下,很快就能传附件了。
若不思报国,与禽兽何异?

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回复 6# 的帖子

刚才有点问题,好不容易才把附件传上来。汗~~
生命诚可贵,实验价更高。

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武林三国
收到了,呵呵,谢谢!

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我也有类似问题pcr 能搞死人啊

我也有类似问题pcr 能搞死人啊
不知道

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