用clustalw比对完后，怎么确定其中的保守区域？
『因为我要用找到的保守区域再去blast，所以需要得到具体的保守区域。』

所有序列共有的序列就是保守序列啊
在GeneBank中有专门的用于寻找保守序列的程序的

仁兄可以讲得更详细点吗，正急需这方面的知识

推荐一下，smart，这个可以将你的结构域名输进去，会自动出现保守序列。 而且在NCBI中，打开BLAST，其中可以选择，输入序列就可以看到了。

会显示红色为保守，但是事实上，这些保守的氨基酸为探针再去blast的效果，不是很好。

建议你用smart试试看。

[ 本帖最后由 youngyoung 于 08-5-23 20:42 编辑 ]

领教了！！！