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[功能研究] 做水稻的基因克隆和功能分析是否需要做RACE


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1# 大 中 小 发表于 08-5-4 15:27  只看该作者
武林三国

做水稻的基因克隆和功能分析是否需要做RACE

达人请回复：



谢谢


我在做一个水稻基因的图位克隆和功能分析，，，，大家知道水稻已经测序完成，，，是否有必要作3'   5'RACE?????/


很是困惑


请达人指教

搜索更多相关主题的帖子: 基因克隆 RACE 水稻 功能分析

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2# 大 中 小 发表于 08-5-5 07:47  只看该作者

如能在数据库里找到你的序列，一般不需要。

如果能在数据库里找到你的序列，并且引物设计的好的话，一般不需要。

RACE是用来扩增5,3末端的，当末端缺失时，在分离MRNA时会带来很大的麻烦，通常结果就是失败，所以在RACE出现前，只能通过反复筛选文库来获得全长，后RACE的出现改变了这个状况

所以，只要数据库里已有你的全长序列，就不需要RACE了，只需从头到尾设计引物就是了；顺便，注意下你要DNA全长还是CDS。
本帖最近评分记录
  • 纤夫 威望 +1 精彩解答 08-5-5 10:48
亲爱的甘荻丽娜
我终将远行
风帆扬起，迷雾散尽

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3# 大 中 小 发表于 08-6-14 15:51  只看该作者
武林三国
我也遇到这个问题，并且买了一个３／race. 但觉得无用，我查许多图位克隆基因做功能时都是把基因连同上下游1500bp 全部转入突变体。包括了启动子和终止子。目前不知怎么预测终止子。哪位大虾帮我分析一下，看我的序列把启动子和终止子包括没有？

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