威望、酷币获取方法及用途&等级说明
基因酷保藏中心资源获取规则
保藏中心资源获取流程详细说明
基因酷保藏中心资源进出明细
各版诚拜版主，每版欲聘5名
生物科研网址导航使用说明
生物科研网络助手使用说明
基因酷资源免费，望您点击广告
来支持基因酷		基因酷大事件回顾
论坛使用说明及酷友指南
基因酷FTP的使用及说明
基因酷个人空间（博客）使用帮助
邀请您参与《生物信息学分析系列图书》编写		祝贺酵母共享平台的建立，征集细胞株共享实验技术支持！
科研文献、资料分享交流倡议
基因酷网络资源调整公告！
情系灾区，奉献爱心
‹‹ 上一主题 | 下一主题 ››
发新话题
打印

[数据库及其应用] ［求助］NCBI的ORF finder怎么使用~~~


点击打开/关闭loongloong_9966详细信息
1# 大 中 小 发表于 08-3-18 13:24  只看该作者

［求助］NCBI的ORF finder怎么使用~~~

如题。我将一个FASTA格式的序列用ORF finder分析，会出现六种图形，然后我再用BLASTX对序列进行比对，按照所出现的图形要求对ORF进行分析。但是总是会碰到两个分析出来的起始密码子位置不一样，终止密码子位置也有不一样的，这样的情况下我应该将哪段作为ORF~~
请高手指点，谢谢啊~~~

搜索更多相关主题的帖子: NCBI ORF finder 求助

TOP


点击打开/关闭downsea详细信息
2# 大 中 小 发表于 08-3-18 19:10  只看该作者
每个密码子由三个碱基组成，加上正向反向，总共是6种翻译的可能性，一般选择最长的orf

TOP


点击打开/关闭loongloong_9966详细信息
3# 大 中 小 发表于 08-3-19 10:03  只看该作者
啊，我知道怎么做了，谢谢版主啦~~~

TOP


点击打开/关闭蓝格盈盈详细信息
4# 大 中 小 发表于 08-7-23 21:26  只看该作者
我想问问楼主你是如何使用NCBI的ORF finder，我还没搜到，先谢谢了
我是菜鸟，请多指教！！！

TOP


点击打开/关闭Raindy详细信息
5# 大 中 小 发表于 08-7-23 22:07  只看该作者
预测的ORF还要进行可靠性验证
·听雨轩·http://www.raindy.org
·红意网·http://www.nn11.com

TOP

‹‹ 上一主题 | 下一主题 ››
发新话题