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[基因分析与比对] 序列比对做同源性分析，紧急求助！！！！


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1# 大 中 小 发表于 08-3-9 20:01  只看该作者

序列比对做同源性分析，紧急求助！！！！

最近要写一篇论文，内容是要对某一地方的去年无名高热蓝耳病病毒（PRRS）进行序列比对，最终得出进化树以分析它和哪个株系更接近。我查了些资料后选择用其ORF5区段进行比对。现在我已找到了这个地方发病病毒毒株ORF5区段序列，也在NCBI上查得了五百对条PRRS P ORF5序列。下一步我该怎么去做呢？

对了，我还把这五百条中较长的序列剔除了，剩下的四百多条序列是大约650bp的。

紧急求助哈，万分感谢！！！！

我是新手，所以很多不懂的！！

搜索更多相关主题的帖子: 序列 同源 求助 序列 同源 求助

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2# 大 中 小 发表于 08-3-9 20:51  只看该作者
一个物种或者一个株选一条序列，然后用mega做，具体的看帖子
http://www.genecool.com/bbs/thread-14134-1-1.html
本帖最近评分记录
  • 纤夫 威望 +1 积极参与 08-3-11 12:51

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3# 大 中 小 发表于 08-3-10 22:39  只看该作者
谢谢哈
还是有点晕

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4# 大 中 小 发表于 08-7-12 11:05  只看该作者

可不可以一个物种或一个株选几个序列做

可不可以一个物种或一个株选几个序列做

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点击打开/关闭Meechen详细信息
5# 大 中 小 发表于 08-9-22 12:02  只看该作者
xiexie~~~~~

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点击打开/关闭shuanhu2007详细信息
6# 大 中 小 发表于 08-9-22 14:45  只看该作者
确定同种得基因，比如都是猪源得，估计没有多少，可以接受了之后，用DNAman比较同源性后，能够体现出同源最高的序列，用眼睛就能看出来，然后根据这段序列设计引物
这条路不光通向成功！

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