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[PCR引物设计] 求助！如何分析blast结果？？


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1# 大 中 小 发表于 08-2-26 16:47  只看该作者

求助！如何分析blast结果？？

大家好！

我才学引物设计，在很多帖子里看到，设计好的引物需要到blast里作对比！
＂引物确定后，对于上游和下游引物分别进行Blast分析＂

我确定了引物，并进行了blast，可是我不懂怎么看blast的结果！
里面有好多东西，我想请教一下各位，怎么分析结果？
需要看哪些指标，怎么判断我的引物可以用，不需要从新设计呢？

感激万分啊～～～～

搜索更多相关主题的帖子: blast 引物 结果 才学 求助 blast 结果 求助

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点击打开/关闭solomon78详细信息
2# 大 中 小 发表于 08-6-5 21:44  只看该作者
同求！

万分感激啊～～～～

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点击打开/关闭yaoyl0679详细信息
3# 大 中 小 发表于 08-6-6 00:22  只看该作者
将你设计好的引物在Blast上比对，看看在同一个菌属里面，或者比较容易污染的菌属里面是否有相似性很高（尤其是3‘端）的序列，如果存在，那么你的引物在扩增的时候有可能扩增到非目的条带，如果你的引物只跟目的片段匹配，那么可以说明你的引物在已知的数据库序列中不会扩增出非目的条带

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4# 大 中 小 发表于 08-7-8 20:33  只看该作者
我也想知道

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5# 大 中 小 发表于 08-7-8 20:35  只看该作者
这个代表什么意思

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6# 大 中 小 发表于 08-7-8 20:37  只看该作者
譬如下面的图代表什么意思
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