SYBR染料为一种非对称菁化物,它作为一种DNA和RNA染料,与菲啶类染料如溴化乙锭相比具有一定优越性。
有三种SYBR染料被用于分子生物学试验中:分别是SYBR GreenⅠ、SYBR GreenⅡ和SYBR Glod。所有三种染料在溶液状态基本不产生荧光,然而,当其结合到核酸上时,将产生很强的荧光以及很高量子产额(quantum yield)。比如,SYBR GreenⅠ在结合到双链NDA上时量子产额为0.8,而SYBR Glod具有0.7的量子产额以及1000倍的增强荧光。由于SYBR染料能产生很强的信号和极低的背景以及对核酸的高度亲和力,它们能在低浓度条件下使用,并比传统的染料如溴化乙锭具有更高的灵敏度。
SYBR Glod是最好的SYBR染料。灵敏度很高,且其信号检测动态范围极佳。由于SYBR Glod通常主要结合在主链的带电磷酸残基上,结合了染料的DNA的电泳迁移会明显减缓,并且有时会造成DNA条带的弯曲。因此,用SYBR Glod进行凝胶染色通常在电泳完成后进行。由于背景染色非常低所以不需要进行脱色。