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minliyu3356 发表于 08-5-9 21:53

zz关于稳定转染真核细胞的鉴定

[b][font=宋体][size=11pt]关于稳定转染真核细胞的鉴定(即外源基因在真核细胞的表达)[/size][/font][/b][b][size=11pt]——
                                                                   [/size][/b][b][font=宋体][size=11pt]一些个人体会(转载)[/size][/font][/b][b][size=11pt] [/size][/b]
[align=left][align=left][font=宋体][size=11pt]真核细胞稳定转染的实验周期较长,从构建载体、转染、筛选单克隆、扩大培养直到鉴定,加起来个把月的时间就扔进去了。而且更重要的是后续实验的延续性,只有对转染细胞的质量进行严格控制,才能满足实验的需要。因此,对转染细胞的鉴定是很慎重的问题,常用的方法有:[/size][/font][size=11pt][/size][/align][/align][align=left][align=left][size=11pt]
1. Western blot([/size][font=宋体][size=11pt]蛋白水平,首选[/size][/font][size=11pt])[/size][size=11pt][/size][/align][/align][align=left][align=left][font=宋体][size=11pt]利用[/size][/font][size=11pt]Western blot[/size][font=宋体][size=11pt]技术,对转染后细胞内是否有目的蛋白[/size][/font][size=11pt]X[/size][font=宋体][size=11pt]的表达进行检测。这里,需要设置好阴性对照和阳性对照。举例说明:例如,我的载体里面有[/size][/font][size=11pt]HIS-tag[/size][font=宋体][size=11pt]标记,那我就可以用[/size][/font][size=11pt]HIS-tag[/size][font=宋体][size=11pt]抗体检测细胞中目的融合蛋白[/size][/font][size=11pt]X[/size][font=宋体][size=11pt]-[/size][/font][size=11pt]HIS[/size][font=宋体][size=11pt]的表达情况。当然,如果手里有针对目的蛋白[/size][/font][size=11pt]X[/size][font=宋体][size=11pt]的抗体那就更方便了,直接用它就可以了。[/size][/font][size=11pt][/size][/align][/align][align=left][align=left][font=宋体][size=11pt]阴性对照:稳定转染空载体的细胞的裂解液[/size][/font][size=11pt][/size][/align][/align][align=left][align=left][font=宋体][size=11pt]阳性对照:表达[/size][/font][size=11pt]X[/size][font=宋体][size=11pt]蛋白的细胞;或者体外表达[/size][/font][size=11pt]X[/size][font=宋体][size=11pt]蛋白的大肠杆菌的菌体裂解液[/size][/font][size=11pt][/size][/align][/align][align=left][align=left][font=宋体][size=11pt]在进行[/size][/font][size=11pt]SDS-PAGE[/size][font=宋体][size=11pt]的时候,将实验组,阴性对照,阳性对照同时在一板胶上电泳,然后转印、杂交、显影。最理想的结果是:阴性对照无带;而实验组和阳性对照出现与目的蛋白[/size][/font][size=11pt]X[/size][font=宋体][size=11pt]分子量相近的条带,且二者位置相当(当然,如果检测的是融合蛋白,则融合蛋白分子量=目的蛋白[/size][/font][size=11pt]X[/size][font=宋体][size=11pt]的分子量+[/size][/font][size=11pt]Tag[/size][font=宋体][size=11pt]的分子量)。[/size][/font][size=11pt][/size][/align][/align][align=left][align=left][size=11pt]
2. RT-PCR[/size][font=宋体][size=11pt]([/size][/font][size=11pt]mRNA[/size][font=宋体][size=11pt]水平)[/size][/font][size=11pt][/size][/align][/align][align=left][align=left][font=宋体][size=11pt]通过[/size][/font][size=11pt]RT-PCR[/size][font=宋体][size=11pt]检测目的基因[/size][/font][size=11pt]X[/size][font=宋体][size=11pt]的转录情况。在进行扩增时要注意设置阴性对照和阳性对照。[/size][/font][size=11pt][/size][/align][/align][align=left][align=left][font=宋体][size=11pt]阴性对照:[/size][/font][size=11pt]RT[/size][font=宋体][size=11pt]反应时,将反转录酶用[/size][/font][size=11pt]ddH2O[/size][font=宋体][size=11pt]代替,其余成分同实验管,同时进行反转录反应后,用[/size][/font][size=11pt]PCR[/size][font=宋体][size=11pt]反应观察能否扩增得到目的片段。[/size][/font][size=11pt][/size][/align][/align][align=left][align=left][font=宋体][size=11pt]阳性对照:以表达该目的基因[/size][/font][size=11pt]X[/size][font=宋体][size=11pt]的细胞作为[/size][/font][size=11pt]RT[/size][font=宋体][size=11pt]反应的[/size][/font][size=11pt]RNA[/size][font=宋体][size=11pt]来源,同法进行[/size][/font][size=11pt]RT-PCR[/size][font=宋体][size=11pt];或者以含有目的基因片段的质粒[/size][/font][size=11pt]DNA[/size][font=宋体][size=11pt]作为[/size][/font][size=11pt]PCR[/size][font=宋体][size=11pt]模板,进行[/size][/font][size=11pt]PCR[/size][font=宋体][size=11pt]反应。[/size][/font][size=11pt][/size][/align][/align][align=left][align=left][font=宋体][size=11pt]在将[/size][/font][size=11pt]PCR[/size][font=宋体][size=11pt]产物进行电泳的时候,将实验组,阴性对照,阳性对照同时在一板胶上电泳,最理想的结果是:阴性对照无带;而实验组和阳性对照有相应大小的[/size][/font][size=11pt]DNA[/size][font=宋体][size=11pt]片段出现,且二者位置相当。[/size][/font][size=11pt][/size][/align][/align][align=left][align=left][font=宋体][size=11pt]但是,切记鉴定实验不是就此结束了,还有一个重要的实验:测序!!如果不经过测序的验证就直接下结论说细胞里有[/size][/font][size=11pt]X[/size][font=宋体][size=11pt]基因的表达,未免有些武断。(个人的感觉是:[/size][/font][size=11pt]RT-PCR[/size][font=宋体][size=11pt]的结果若不经测序验证,心中惴惴不已,何谈信心去做下一步实验。)[/size][/font][size=11pt][/size][/align][/align][align=left][align=left][size=11pt]
3. [/size][font=宋体][size=11pt]其他[/size][/font][size=11pt][/size][/align][/align][align=left][align=left][font=宋体][size=11pt]如原位杂交,免疫荧光,免疫细胞化学,活细胞[/size][/font][size=11pt]GFP[/size][font=宋体][size=11pt]观察等则见仁见智,各位酷友可以在文献中[/size][/font][size=11pt]search[/size][font=宋体][size=11pt]看看![/size][/font][size=11pt][/size][/align][/align][align=center][align=center][font=宋体][size=10pt] [/size][/font][/align][/align][font=宋体][size=11pt]基因转染技术有鳞酸钙介导的转染法、[/size][/font][size=11pt]DEAE[/size][font=宋体][size=11pt]葡聚糖介导转染法、脂质体介导转染法及电穿孔等。靶基因被导入细胞后,一般在转染后[/size][/font][size=11pt]48[/size][font=宋体][size=11pt]小时,靶基因即在细胞内表达。根据不同的实验目的,[/size][/font][size=11pt]48[/size][font=宋体][size=11pt]小时后即可进行靶基因表达的检测等实验(即[/size][/font][font=宋体][size=11pt]瞬时转染[/size][/font][font=宋体][size=11pt])。如若建立稳定的细胞系,则可对靶细胞进行筛选,根据不同基因载体中所含有的抗性标志选用相应的药物,最常用的直核表达基因载体的标志物有潮霉素([/size][/font][size=11pt]hygromycin[/size][font=宋体][size=11pt])和新霉素([/size][/font][size=11pt]neomycin[/size][font=宋体][size=11pt])。筛选后可以得到稳定表达外源基因的细胞克隆,这就是[/size][/font][font=宋体][size=11pt]稳定转染[/size][/font][font=宋体][size=11pt]。[/size][/font]
[font=宋体][size=11pt]稳定转染和瞬时转染的区别就是在转染后是否用药物筛选。[/size][/font][size=11pt][/size]
[align=center][align=center][font=宋体][size=10.5pt]我常采用的方法是RT-PCR鉴定目的基因的mRNA,然后进行间接免疫荧光鉴定,最后是WB,一般经过这3步基本上可以明确稳定转染的成功与否。
此外还需注意几点:

1,采用RTPCR法鉴定的时候,最好用DNA酶处理一下提取的RNA然后再进行RT-PCR,以避免残留的质粒或其他污染。 [/size][/font][/align][/align][align=center][align=center][font=宋体][size=10.5pt]
2[/size][/font][font=宋体][size=10.5pt],采用WB的时候需要注意,如果表达水平一般不是很好,采用HRP-DAB或者HRP-TMB系统,其检测灵敏度在100pg以下,可能不能满足你用来检测真核细胞蛋白表达检测的需要,建议采用灵敏度更高的化学发光WB检测。[/size][/font][/align][/align][font=Calibri] [/font]

纤夫 发表于 08-5-12 08:46

回复 1# 的帖子

呵呵,我说怎么瞅着眼熟,这个应该是基因酷的原创帖子,原帖在这里:
[url]http://www.genecool.com/bbs/viewthread.php?tid=2406&page=1#pid8190[/url]

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